區別如下：

第一，名稱不一樣，分別叫生物工程和生物醫藥，

第二，內容也不一樣，生物工程主要是指一些生物技術在實踐領域是怎麼應用的？怎麼去生產一些生物製品？比如說疫苗，抗體，血清等等，而生物醫藥主要是為醫院提供一些服務的，比如說製藥行業或者醫療設備行業。

生物工程和生物製藥的區別：

1、生物工程偏工科比如工藝設計或者是工程制圖等等方面，生物製藥偏藥品方面。

2、畢業後生物工程基本上是進食品廠或者是和生物相關的一些廠如汙水處理廠或者儀器設備等公司，生物製藥的話基本上進的是藥企，基本的崗位是研發或者是銷售，研發的話建議最好是上到研究生。

生物醫藥是生物工程中的一項，生物工程是一龐大工程，涵著與生物有關的許多項內容

製藥工程會好一些。

21世紀以來，中國製藥工業發展迅速，已成為世界製藥工業大國，製藥工業在保障人民身體健康和促進社會可持續發展方面發揮著越來越重要的作用，並已成為推動國民經濟發展的支柱產業和戰略性新興產業，製藥工程專業擔負著為製藥行業培養和輸送高素質專門人才的重任。

培養目標

培養掌握製藥工程專業及相關學科的基本理論和專業知識，具有良好的創新意識、創業精神和職業道德，具備分析、解決複雜工程問題的能力以及創新創業能力，能夠在製藥及相關領域從事科學研究、技術開發、工藝與工程設計、生產組織、管理與服務等工作的高素質專門人才。

製藥工程和生物醫學工程都屬於醫學範疇下的不同學科方向。主要是應用醫學領域，製藥工程傾向於藥物研發和製造；生物醫學工程傾向於醫療器械的研發和生產。目前，在這兩個領域國家估計去進口，中國產替代化，因此，未來發現相對都比較好。

製藥工程是一門普通高等學校本科專業，屬化工與製藥類專業，基本修業年限為四年，授予工學學士學位。該專業要求學生掌握化學、藥學、製藥工程和化學工藝等方面的基礎理論和基本知識，掌握藥物合成，有機精細化學品的基本合成、改性和配方的基本原理和基本技能，培養具有製藥過程方面的生產、經營管理、科研開發、應用研究的高級工程技術人才。

可能和大家理解的不太一樣，生物醫學工程主要研究生命科學、電子技術、計算機技術和信息科學等方面的基本知識和技能，包括生物材料、人工器官、生物醫學信號處理方法、醫學成像和圖像處理方法等。例如：人工心臟、人工關節等人工器官的研發，腦CT機、核磁共振儀等醫療設備的操縱和維護，B超、核磁共振成像的圖像處理等。

兩個專業的選擇，主要看個人的興趣方向，化學基礎好的可以考慮製藥工程；物理及數學比較好的，可以選擇生物醫學工程專業。