雙子葉植物為直根系，主要由主根和側根組成，單子葉植物為鬚根系，主要由不定根組成

雙子葉植物與單子葉植物，兩者的根系及根結構都有不同。

雙子葉植物常為直根系，主根發達，主側根明顯，直根系入土深具有深根性。根有形成層，能進行次生生長，所以能增粗。

單子葉植物常為鬚根系：主根不明顯，根系成叢生狀，鬚根系入土淺具有淺根性。根無形成層，不能進行次生生長，所以增粗有限。

在初生根方面，二者共同點為：均由表皮、皮層和維管柱三部分組成；成熟區表皮具根毛，皮層有外皮層和內皮層，維管柱有中柱鞘；初生維管組織的發育順序、排列方式相同。不同點是：

1）表皮層：在暴露於地面部分,有可能在外壁發生角質化,甚至引起整個細胞壁的木栓化或木質化。

2）皮層：單子葉外皮層除薄壁細胞外，偶有木質纖維。

單子葉內皮層除靠近導管的通過細胞外，其餘細胞不僅半徑向側壁木栓化或木質化，而且切線向內側壁，甚至整個細胞壁皆木栓化或木質化增厚。

3）中柱：單子葉織物初生木質部起源較多，常達8～30餘出，髓部極其發達明顯。中柱鞘及其內的一切薄壁組織都沒有恢復分生能力，不能轉化成為形成層。

相同點：

均由表皮，皮層和維管柱三部分組成，各部分的細胞類型在根中也基本一致，根中初生韌皮部發育順序均為外始式。

不同點：

1、內皮層不同

雙子葉植物根的內皮層增厚主要為凱氏帶(點)；而單子葉植物根的內皮層除凱氏帶(點)增厚形式外，有的植物則為馬蹄形增厚。