一、性質不同

1、紙層析：用紙作為載體的一種色譜法。

2、薄層層析：色譜法中的一種，是快速分離和定性分析少量物質的一種重要實驗技術。

二、用途不同

1、紙層析用途：常用於葉綠素色素、氨基酸的鑒定和測定、桔皮精油成分的測定和一些特定細胞的篩選實驗。

2、薄層層析用途：適用於揮發性較小或較高溫度易發生變化而不能用氣相色譜分析的物質。

區別：從高效薄層色譜和普通薄層色譜的薄層板的比較可以看出，高效薄層板較普通薄層板顆粒直徑小，顆粒度分布窄，分辨率提高，展開距離縮短，因而展開時間縮短，3～20min可以完成一次分析。HPTLC 較常規TLC分離度、靈敏度和重現性提高。

高效薄層板一般為商品預製板，由顆粒直徑5～7um的固定相，用噴霧法制成板。常用的有硅膠、氧化鋁、纖維素和化學鍵合相薄層板。

對複雜樣品來說，高效板能達到更好的分離效果

感覺上主要是效率高低程度的差別，具體適用什麼還要視情況而定

1.分離效果好，塔板數高。

2.點樣斑點小，便於系列分析。

3.分離時間短。

4.靈敏度高，斑點清晰，不擴散。 依照規格可分為： G型H型GF254HF254另有分為普通板和高效板！ H是Hard的簡稱 G是Glutinous的簡稱 F是Fluorescent的簡稱 硅膠H：不含粘合劑，不含熒光劑； 硅膠G：不含熒光劑，含煅石膏粘合劑； 硅膠HF2

54：含熒光物質，可用於波長為254nm紫外光下觀察熒光； 硅膠GF2 54：既含煅石膏又含熒光劑，可用於波長為254nm紫外光下觀察熒光

區別在於高效薄層板是環保節能式材料，而普通薄層板則是耐用結實式材料。