我們可以使用以下方法來使用濾棉和濾材。

首先，在底濾的第一倉，我們可以擺放各類過濾棉以及生化棉。

其次，在底濾的第二層，我們可以擺放一些規則的濾材，比如陶瓷環，珊瑚骨等。

最後，我們可以在底濾的第三倉擺放培菌效果最好的細菌屋。

三格底濾缸濾材一般第一格是進水格，從上至下依次可放置：濾棉—生化棉—生化球（也可以放在溢流區）—菌屋—藤面。

第二格則放置細菌屋等濾材，也可以上半珊瑚石下半細菌屋；第三格是抽水格，可以放置抽水泵，滅菌燈，溫度計，加熱棒，麥飯石，火山石，沉木等。值得注意的是，加熱棒最好放在底濾格之間的夾縫處。

然後思想觀賞魚的過程中使用三層底濾的魚缸，一般來說都是大型飼養的觀賞魚缸層層底濾的濾材擺放的順序首先是過濾棉，生化棉。消化棉用來進行物理過濾。而後經過陶瓷環細菌屋和火山石培養消化細菌，進行生化過濾。第三層用來做沉澱倉就可以了。

第一層擺放濾棉，白棉或綠白棉放三層左右，不能太多，防止水流大，濾棉溢流。濾棉下方放一片生化棉，既有增加氧氣作用，也有培菌作用。

第二層擺放生化濾材，細菌屋陶瓷環等，是最重要一個倉。 第三層放置過濾泵以及一些火山石等淨化水質的石頭。

第一格子放是出水口的位置，最上層放上過濾棉4層，然後放生化棉，一到兩層，然後放生化球在最下面，厚度可以掌握，後面的格子水淹到的地方，全放洗好消毒過的陶瓷環，盡量挑選不容易掉白粉的那種，最後的位置是清水池，裡面是放水泵的，可以弄一兩隻小蝦，

小魚放進去，防止水槽內時間長了生蛋白蟲，一旦有了很不好清除 以上是個人建議，最基本的原則就是濾棉攔截大的，不能硝化的懸浮物，進行初步過濾，中間的生化棉生化球陶瓷環是起到分解魚缸內排洩物，使水質變清的最重要的環節，然後到清水池少過沉澱再抽回魚缸。