碩士生導師和教授不能確定誰的職務大。首先，教授是一個職稱，碩士生導師是一個資格，兩者之間沒有可比性。

其次，職務一般是指行政職務也就是系主任，院長等等一系列行政職務，這個職務與上述兩個更沒有關系了，可能教授也不是系主任。所以不能進行比較。

一般來講，教授要比碩士生導師職務大，要成為碩士生導師必須是副教授，而教授可以是碩士生導師和博士生導師，副教授不能是博士生導師，所以從這方便來講教授的職務比碩士生導師大。如果碩士生導師是教授的話，那他們相比就是平級的。

博士和副教授屬於兩個慨念範疇。不存在誰大誰小的問題。

博士，指是學曆。比如某某同學在某某大學某某研究生學院學習，畢業後獲得博士學曆。

副教授，指職稱是副教授。比如某某同志在某某大學某某學院任副教授，從事教師工作，為國家教書育人。

博士和副教授沒有可比性，因為博士和副教授概念不同內含也不同，博士是指最高學歷和最高學位是博士，副教授是技術崗位職稱是副教授，博士可以被聘為副教授，也可以被聘為教授，但老牌的副教授、教授有的還不是博士學曆和博士學位所以二者沒有必然聯繫，也不能相提並論。

我想提問者是問博士與副教授誰的學術水平高吧？因為年齡和職務都不好比。如果就學術水平而言，副教授比剛剛畢業的博士要高！通常博士畢業在大學任教可以認定為講師職稱也就是中級職稱，如果這個博士教學科研水平成績突出，經過四年以後可以申報副教授資格，通過評審才能獲得副教授職稱。實際上由於中國學位教育發展比較遲 ，年齡大一點的不少副教授或者教授並沒有博士學位但不影響他們說博士生導師。

博士是學位，副教授是副高級職稱。不是一回事。

博士畢業後，一般可以認定為中級職稱（講師），2年後可以評副教授。