印度尼西亞有兩種特別出名的咖啡，分別是蘇門答臘咖啡和麝香貓咖啡。

蘇門答臘咖啡以星巴克而聞名，來自蘇門答臘島，位於該國西部的大島上，蘇門答臘咖啡具有堅果和菸草的味道，酸度低，這是該地區的典型特徵。

麝香貓咖啡是由貓類動物的糞便製成的，麝香貓吃了咖啡漿果後，因為麝香貓的胃不能消化咖啡豆，因此咖啡豆便留在其糞便中，從糞便中掏出咖啡豆，經過收集，清潔和烘烤而製成。

麝香貓咖啡主要生產地在蘇門答臘島，爪哇島，巴厘島和蘇拉威西島。麝香貓咖啡吃咖啡時會經過附近的生殖器宮，咖啡豆的蛋白質會在胃中被分解，咖啡豆因而沾了分泌出來的油脂，產出的咖啡別有一番滋味，口味層次感強，麝香貓咖啡堪稱是世界上最昂貴的咖啡，每磅約300美元。

最有名的的是貓屎咖啡 麝香貓咖啡 (Luwak) ： 麝香貓咖啡 ：來自印度尼西亞蘇門答臘島的咖啡，不是以來源出名，而是以用一種獨特的新式處理法的加工模式獨特而出名。

一種哺乳動物叫做麝香貓，吃了成熟的咖啡漿果後，麝香貓的消化道會把咖啡櫻桃果的外層腐蝕掉，消化然後排洩出種子，從糞便中挑出咖啡豆，這些排放出來的咖啡豆會經過清洗及篩選，這種咖啡由於產量很少， 且因為它的稀有和特別味道而成為世界上其中一種罕見的咖啡，也是最昂貴的咖啡之一。