1、藍藻不是植物，而是微生物。

2、藍藻又名藍細菌，是一種原核生物，沒有亞細胞結構，即沒有細胞核、線粒體、葉綠體、中心體等。不能進行有絲分裂。而植物是能夠進行光合作用的陸生多細胞真核生物，所以藍藻不是植物。

3、大多數藍藻的細胞壁外面有膠質衣，又叫粘藻。在藻類生物中，藍藻是最簡單、最原始的單細胞生物，沒有細胞核，細胞中央有核物質，通常呈顆粒狀或網狀，色素均勻的分布在細胞質中。核物質沒有核膜和核仁，具有核的功能，故稱為原核（或擬核）。藍藻中有環狀DNA質粒，擔當運載體的作用。

微生物。藍藻是單細胞生物，沒有細胞核，但細胞中央含有核物質。藍藻是最早的光合放氧生物，對地球表面從無氧的大氣環境變為有氧環境起了巨大的作用。有不少藍藻（如魚腥藻）可以直接固定大氣中的氮（原因：含有固氮酶，可直接進行生物固氮），以提高土壤肥力，使作物增產。

還有的藍藻為人們的食品，如著名的髮菜和普通念珠藻（地木耳）、螺旋藻等。