比較正宗的菩提珠顏色大多是白色或者乳白色的，也有白色、紅色、綠色、紫色灰色這幾種顏色，可以用來做手鏈也可以當項鍊飾品，搭配起來特別好看。

菩提珠通常都是紅棕色的，在Sunny下會顯得略微透明。但也有一些菩提珠是青色、紫色或黑色的。這些顏色相對來說比較少見，通常會被認為是更加珍貴的菩提珠。總的來說，菩提珠的顏色並不是關鍵，更重要的是珠子所代表的含義和信仰。

藍色菩提手串盤好後是土黃色。

菩提的內部有一種叫花青素的色素，會隨著一些酸鹼性物質而變色。藍色的菩提手串，它在和空氣氧化之後才慢慢變成了最開始盤玩之前的土黃色。

菩提手串盤好了是黃色，新的菩提手串顏色為乳白色，經過長時間的盤玩後，剛開始會變成黃色系，再進一步風化一段時間後，會出現咖啡色系，對於部分盤玩兩年左右的菩提手串，還會有陰皮綠色系這種特別的顏色。

奶白色。

菩提珠拋光出來是奶白色的上邊有自然形成的黑點，這是正常顏色就是沒有盤玩時正常的顏色，等長時間把玩後會包漿。

都是染色的，天然的菩提根就只有白菩提根和花菩提根，其他像紅黃紫色的菩提根，都是人工染色而成的。而用手觸摸天然菩提根會有像樹脂一樣的粘稠感，如果不是就有可能是假貨了。所以，我們在挑選菩提根佛珠手串的時候要特別注意這些。