至尊紅顏大結局是李君羨死了，死在了武媚娘的懷裡，武媚娘繼續做李治的皇后，武媚娘給了盈盈選擇生死的機會，盈盈喝下了兩杯酒，死前和媚娘敞開心結。

盈盈見媚娘權勢日益扶搖直上，更是嫉恨不已，又將詭計轉向離間媚娘與其所生太子李弘之間的母子關系。李弘本就狂妄任性，瞞著母后媚娘在京中招搖生事，竟遇到隱於民間的君羨，君羨初不知李弘身份，故而將其大大的教訓了一番。

而當時有異族王子赫圖欲興兵反唐，假借進貢入觀，潛伏於京中密謀行事。盈盈得知情事便勾結赫圖意圖滅了媚娘，二人分掌大唐江山。最後關頭，在君羨及上官婉兒的明暗相助下，化解了這一場足以毀朝滅國的天大危機，盈盈在最後關頭事敗之後畏罪自盡。

結束了其與媚娘恩怨糾葛終生的爭鬥。李治縱情聲色，不幸英年早逝，由其子李旦接位。

只是李旦臨政，國勢日衰，媚娘不計毀譽，逐李旦下位，本身起而代之，中斷了大唐國朝，定國號為周，是為日月當空金輪女天皇，大興吏治，開科取士，招納賢才共襄國事，並召令天下女尼還俗

至尊紅顏的大結局是長孫無忌為了救李君羨公開先皇遺詔，皇帝被民眾要求退位，李君羨被押赴刑場獲救，卻不願推翻皇帝的統治選擇自殺，武媚娘在城樓上看著，不顧一切跑下來，與他相擁。李君羨死在她的懷中。

武媚娘最終登基為帝，臣下給她找來了長得像李君羨的人，那人的工作是打鐵的。

至尊紅顏大結局：君羨為了天下太平，當眾自刎以示忠君。媚娘感謝凌靜對君羨的一片痴心，將君羨骨灰交予凌靜，讓凌靜將君羨骨灰帶到安靜的地方去。媚娘向皇上說明小多的死因盈盈嫌疑最大。皇上願隨媚娘同去觀狄仁傑斷案。盈盈終於承受不住，承認了自己的罪過。媚娘這才知道母親和小公主都是盈盈害死的。皇上也十分驚奇。

媚娘派人到牢中找來盈盈，在空靈堂前，媚娘讓盈盈從一杯毒酒和一杯普通酒中選擇，盈盈將兩杯酒都喝下。媚娘要盈盈將所有的事情從頭至尾講出來，盈盈毫無保留地將所有的事情一五一十地講了出來：預言石、武母的死、傷害媚娘和小公主的歌謠、小公主的死、小多的死…… 若干年後，媚娘終於成了一代女皇武則天。婉兒要狄仁傑告訴自己媚娘想念的那個人的樣子，狄仁傑無意間發現了一個與君羨長的一模一樣的人。婉兒將他帶到宮中，命他向媚娘直呼其名。老年的媚娘仿佛見到君羨，老淚縱橫。