1地理位置不同，T1航站樓是老航站樓，位於長寧區，在機場跑道的東側;T2航站樓是新航站樓，位於閔行區，在機場跑道的西側，此處還有虹橋綜合交通樞紐。

2航班不同，T1航站樓有國際航線和國內航線，而T2航站樓基本上只有國內航線。

虹橋機場1號航站樓和2號航站樓的區別是：停機位不同、面積不同、設施系統不同。
1、停機位不同
上海虹橋國際機場1號航站樓有停機位66個，其中有13個登機橋位，48個遠機位，2個專機位，2個貨機位。而2號航站樓有89個機位，45座登機橋，近機位比例超過70%，其中8個機位可以同時停靠3種機型組合的混合式橋位。
2、面積不同
上海虹橋國際機場1號航站樓的面積達8.2萬平方米（A樓5萬平方米，B樓3.2萬平方米）；而2號航站樓面積為36.26萬平方米。
3、設施系統不同
1號航站樓共有15個候機大廳，18個貴賓室和15條行李傳輸系統。而設有母嬰室35間，為殘障旅客設置了48間衛生間、16臺升降電梯、4個問訊櫃臺等無障礙設施。

區別在於：

1、建設時間不同，虹橋機場1#航站樓用了幾十年了，設施能力已經不能滿足旅客流量的需求，所以在1#航站樓以西（市郊方向）進行了2#航站樓的建設。

2#航站樓與2010年3月16日投入啟用。

2、航班不同，目前是國際航班（日、韓、港、臺等）均在1#航站樓，還有春秋航空的國內航班在1#航站樓，其餘所有航班均在2#航站樓。因為2#航站樓是新建的，所以設施都較新，空間也較寬敞。

3、地鐵通達的線路不完全相同，1#航站樓地鐵只有10#線能到達，2#航站路地鐵有2#線和10#線均可到達。

分布的航班不同

虹橋1號航站樓和2號航站樓的區別主要在於分布的航班不同。1號航站樓（T1）主要運營春秋航空除外的國內航班以及上海至香港、日本、南韓的國際航班；而2號航站樓（T2）主要運營東航、上航、國航、南航、廈航、深航、山東航空、海南航空、天津航空、四川航空、吉祥航空、中國聯合航空等航空公司的國內航線。此外，兩個航站樓的位置也不同，距離相差大約6公里。