《庭院深深》講述的是一個美國歸來的博士方絲縈，為了一個她為之心動的小女孩，留在一個偏僻的地方，當了一個小學的老師。這個美麗聰明的女孩叫柏亭亭，她有一個瞎了眼的父親，有一個美麗但凶惡的繼母。小女孩為了不讓瞎了眼的父親操心，忍受著繼母的一切。漸漸知道了小女孩的一切，知道她成績不好，愛說謊，方絲縈決定要幫助她。方絲縈主動要求給女孩補課，柏亭亭的父親柏霈文知道後，執意要方絲縈搬到他家裡來住，做亭亭的家庭教師。

方絲縈到了柏家，才知道柏霈文給自己準備了一個特別的房間，方絲縈震動了。柏霈文問她是否滿意這樣一個房間，方絲縈只能說他不必如此。幾天後，柏霈文的妻子回到了家，她不理解這個不受理人的丈夫為何如此地寵愛一個家庭教師，而且打破了他自己定下的規矩，把家裡插滿了玫瑰花。她刁難方絲縈，希望她能離開，但方絲縈在柏霈文的哀求下，留了下來。

幾天後，柏霈文打電報請來了以前的一個朋友高立德。真相終於大白了，原來，方絲縈就是柏霈文深愛著的、以為死去了的前妻章含煙。