主要是原理不同、適用範圍不同、步驟不同。

1.原理不同

蒸發結晶：通過蒸發溶劑，使溶液由不飽和變為飽和，從而使過剩的溶質就會呈晶體析出，叫蒸發結晶。例如：當NaCl和KNO3的混合物中NaCl多而KNO3少時，即可採用此法，先分離出NaCl，再分離出KNO3。

降溫結晶：先加熱溶液，蒸發溶劑成飽和溶液，此時降低熱飽和溶液的溫度，溶解度隨溫度變化較大的溶質就會呈晶體析出，叫降溫結晶。例如：當NaCl和KNO3的混合物中KNO3多而NaCl少時，即可採用此法，先分離出KNO3，再分離出NaCl。

2.適用範圍不同

降溫結晶適用於溶解度隨溫度變化大而且是隨溫度降低而降低的溶質，比如NaNO₃、KNO₃等。高溫時溶解度高，冷卻熱溶液時，其溶解度下降，溶質結晶析出。

蒸發結晶適用於溶解度隨溫度變化不大的溶質，比如NaCL、KCL等。因為溶解度變化小，所以不論冷熱都溶解度變化不大，只有通過（加熱蒸發）減少溶劑（水）才能使其析出結晶。

3.步驟不同

蒸發結晶直接在蒸發皿中加熱蒸發溶液至出現大量晶體（或有晶膜出現）即停止，用蒸發皿的餘熱將剩餘的溶劑蒸乾。

降溫結晶先要加熱濃縮得到熱飽和溶液，然後趁熱過濾除去不溶性雜質，再冷卻結晶，過濾，得到的晶體中還可能含有其他雜質，若要進一步提純，再進行重結晶。