有以下幾種原因：

一是高鐵線路與普通鐵路在設計上是存在不同，不是簡單的認為高鐵線路就能跑貨運列車，這主要是動車組與貨車的軸重是不一樣的，而且載重重量也不一樣，一般貨車自重加載重為80多噸，動車組一輛就只有30噸左右吧，在不同速度不對鋼軌的沖擊也不是一樣的，這在設計上是需要考慮的。

二是高鐵與貨車混合在安全上有影響的。高鐵動車安全絕不能有任何問題，生命至上必須牢固樹立。高鐵線路跑貨車，貨車裝載的貨物等存在撒漏等，在列車高速交會時會對鄰線動車組安全造成影響，還有其它諸多問題。

三是運輸組織上存在問題。在鋪畫列車運行圖時，由於動車、貨車運行速度不一樣，不可能平行追蹤運行，存在停車避讓、越行等，直接影響動車開行。業內有個係數，如果開行1趟客車，就要影響1.5～2到的貨車，動車肯定影響更大了。

四是動車與貨物列車混跑線路也有，那一般是160公里線路及以下，也即屬於普速線路，不屬高鐵線路範疇了，部分區段也運行動車組，存在混跑的情況，這屬正常行車組織。

目前高鐵不用於貨運原因：

首先，高鐵的目的就是客貨分運，提高列車運行速度，提昇運輸效率。動車組和貨運列車牽引方式不同：動車組分散動力以求獲得更高的速度，但牽引力不如貨車，貨運列車使用機頭集中牽引，獲得更大的牽引力，保證高運載量，不求速度。

貨運列車只能在普速鐵路和重載鐵路上行駛，線路能夠承受較高的重量，同時有砟軌道增加了軌枕的彈性，加大軌枕的承載能力。而高鐵的無砟軌道是沒辦法承受貨運列車重量的。