要讓本田XR-V的啟停功能在更換新電瓶後正常工作，您需要進行以下操作：

1. 更換電瓶後，首先需要將電子控制單元（ECU）進行復位。您可以斷開電源或通過 OBDII 診斷工具完成此操作。復位後，所有存儲的錯誤代碼都會被清除。

2. 檢查電池電壓和電流。檢查電瓶的電壓和電流是否與車輛要求的規格相符，特別是對於啟停功能的車型來說，電流是非常重要的。

3. 進行匹配程序。在更換電瓶後，您需要將新電瓶與車輛的控制程序進行匹配。本田XR-V需要使用 HDS（Honda Diagnostic System）來進行匹配程序。在匹配程序中，您需要根據電瓶的容量和車輛的型號，設置正確的參數，以確保啟停功能正常工作。

4. 駕駛車輛進行適應性學習。在完成匹配程序後，駕駛車輛進行適應性學習。適應性學習將花費一些時間，直到系統自適應交通環境和駕駛習慣。

需要注意的是，以上步驟可以保證啟停功能正常工作，但如果您不熟悉操作，建議去授權的本田汽車維修中心進行匹配和適應性學習。