菌蓋下的菌褶部分或菌管部分會留下很多的泥巴，用一般清洗方法很難洗乾淨，菌柄部分由於相對較為光滑，所以相對於菌蓋部分較易清理。可以嘗試這樣洗：1.

把菌柄和菌蓋用小刀或手掰開,分別清洗,不要浸泡，否則菌子含水增加,會減少香味。

2. 把水開到最小,邊刷邊洗,先用牙刷輕輕洗去菌柄上的泥土，你會發現這個很容易做到。

3. 清理完菌柄後，再用牙刷輕輕洗去菌蓋上的泥土，並同時把水開到最小,邊刷邊洗,

最後用牙刷刷去菌蓋下面也就是菌褶上面的泥土，注意不要用力過度，否則蘑菇易碎，不成形。

4.接著反復漂洗，還是要先洗菌柄，後洗菌蓋，這樣可以達到節省用水的目的，直到洗乾淨為止!以上方法適用於大多數的蘑菇，如傘菌等。

如果你要清洗的是白參(裂褶菌)，就要用另外的方法：1.用剪刀剪去基部的木屑，粗揀，去掉雜物和雜菌。

2.用牙刷刷洗一次。

3.反復揉洗，去除上面的木屑細顆粒以及灰塵等雜物，直至水變清。

4.用開水把洗好的白參放入沸水中煮10多分鍾，可去除其表面的黴菌。

5.煮好後用手捏幹水分，放在簸箕上日光照射，直至完全晾乾，這個時候就可以放入食品袋內保存，放食用時只需直接取出稍微清洗後，烹飪即可。但要注意選擇天氣晴朗的日子進行清洗，否則容易長黴。