在修剪臍橙樹之前，先要準備好適宜的用具，一般需要準備一半專用的鋒利剪刀，一些乾淨的草木灰，以及稀釋大約500-1000倍左右的高錳酸鉀溶液或是多菌靈溶液等，並用溶液為準備的用具進行一次消毒的處理。

臍橙的幼樹生長勢態比較強，但枝條的再生速度不算非常快，因此為其修剪主要是以控制植株的造型為主，擴大樹形、拉開樹枝，讓其能夠形成一個繁茂膨大的樹冠，這種植物四季抽稍，因此只要條件合適四季都可以進行修剪。

對於已經生長成熟的果樹來說，為其進行修剪則主要是以增加果樹的通風透光能力、調節植株的長勢為主，要剪去樹冠中的龐雜枝條等，以及其在花果期的弱花弱果，培養出健康的結果枝，以保證最終收獲的時候的果實質量。

1、短剪疏剪

短剪就是我們常說的短截，也就是將一年生枝的部分剪除，然後保留原枝的一部分。短截主要是為刺激臍橙剪口下萌芽，促使抽發新生壯梢，增強臍橙的生長能力與結果性。然後疏剪就是將臍橙樹枝條從基部剪除。疏剪對於保留的枝條能夠促使其加粗加長，提高樹體內的通透性，增強臍橙樹葉片的光合作用，對花芽分化是非常有利的。能夠明顯提高臍橙的坐果率與果實品質。疏剪主要是以病蟲枝條以及徒長枝、過長枝等為主要修剪對象，以去弱留強為原則。

2、抹芽放梢

臍橙的抹芽一般應在夏秋梢長到大約兩厘米左右的時候進行，將一些無利用價值的不需要嫩芽抹除。然後再經過多次抹芽之後不再需要抹芽時，讓大量芽同時抽發的話，便是放梢了。臍橙因為是復芽，對於一些零星早抽的芽來說，在抹除之後會導致周圍其它的芽萌發，從而抽發大量新梢，因此要注意反復抹除多次，一直到放梢時間停止。主要還是用於臍橙樹抹除夏梢，避免夏梢搶奪幼果的生長營養而出現落果現象。

3、摘心緩放

摘心其實也是屬於一種短剪的，適當摘心對於枝梢的生長是非常有利的。能夠提高樹體的營養積累，增強枝梢的生長能力。當新梢長到一定長度且未木質化的時候，直接將其嫩梢頂部摘除即可。在七月份的時候，摘除夏梢的延長枝和徒長枝促使分枝抽發。然後在10月份的時候，對長梢進行摘心，有利於花芽分化。緩放就是對臍橙一年內生長的枝條不進行任何修剪，讓其生長，一直到開花結果，主要對象為結果母枝。

4、回縮環割

回縮就是從臍橙樹的分枝處剪除一些多年生的枝條。一般用於大枝頂端衰退或者是樹冠內膛枝條少的成年樹上，更新樹冠的大枝。能夠提高樹冠內部的通透性，增強樹勢。環割就是將枝條的韌皮部用小刀割除，一直到木質部，但是不傷害木質部。主要為為了限制韌皮部的運輸，避免營養往臍橙樹下部運輸，提高環割部位以上的營養積累。

嫁接的臍橙苗定植第1年內，留一個主幹，離地高度留足15-20厘米，臍橙樹主幹高度以20厘米為宜，寬皮柑橘類主幹高度以15厘米為宜。

定植當年柑橘植株整形帶一般確定在留足主幹高度以上10-15厘米內，留足方位錯開、間距3厘米左右的3個分枝，培養成主枝。

定植第2年，在各主枝上培養2至3個副主枝。定植第3年，在各副主枝上培養2-3個側枝。爾後，逐年培養則枝組，形成結果母枝，培養早結果、豐產樹冠。