一、原理不同

1、紅外分光光度計：由光源發出的光，被分為能量均等對稱的兩束，一束為樣品光通過樣品，另一束為參考光作為基準。這兩束光通過樣品室進入光度計後，被扇形鏡以一定的頻率所調製，形成交變信號，然後兩束光和為一束，並交替通過入射狹縫進入單色器中。

2、傅里葉紅外光譜儀：是基於對干涉後的紅外光進行傅里葉變換的原理而開發的紅外光譜儀。

二、構成不同

1、紅外分光光度計：探測器將上述交變的信號轉換為相應的電信號，經放大器進行電壓放大後，轉入A/D轉換單位，計算機處理後得到從高波數到低波數的紅外吸收光譜圖。

2、傅里葉紅外光譜儀：由紅外光源、光闌、干涉儀（分束器、動鏡、定鏡）、樣品室、檢測器以及各種紅外反射鏡、激光器、控制電路板和電源組成。

三、應用不同

1、紅外分光光度計：可廣泛地應用在石油、化工、醫藥、環保、教學、材料科學、公安、國防等領域。

2、傅里葉紅外光譜儀：廣泛應用於醫藥化工、地礦、石油、煤炭、環保、海關、寶石鑒定、刑偵鑒定等領域。