1、魚缸裡種植大量水草或者鋪設大理石等，具有淨化能力，建立一個生態過濾系統，使硝化細菌大量繁殖，通過它們對糞便及其他汙染物進行分解，成為植物的養料，植物又向魚類提供充足的氧氣。

2、也可以利用虹吸原理，將糞便清除，用軟管按照虹吸原理將水中髒物帶水一起吸出，然後補進水質相同或盡量相近的水，可換一半的水，不必要全換水。

3、飼養一些具有清潔能力的魚兒，在眾多的清潔魚中，清道夫是最為有名的，它們能夠起到淨化水質的作用；這種魚可以將散落在水底的殘餌和糞便吃掉，短期內能夠改善水質。

4、及時地處理魚缸的過濾系統；可在魚缸裡裝上電動過濾設備，接上電源，可以自動工作，過濾去水中大顆粒雜物，需及時清洗過濾材料。過濾系統可以在缸內形成水流，從而將水底的汙物帶走，被吸水口吸入到濾槽中。

5、直接換水。如果魚缸中沒有過濾設備，糞便就要靠人工清理了，一般是在換水的時候進行。由於換水要先抽水，所以可以將水管通到缸底，這樣在抽水的同時，就可以把水底的汙物一併帶走，之後再兌入新水就可以了。