1.科屬不同

葛根，中藥名。為豆科植物野葛的乾燥根，習稱野葛。

蕨根為鳳尾蕨科植物蕨的根莖，在秋、冬採集"蕨"的根部，洗淨、晒乾，即為蕨根。

2.形態特徵不同

葛根，多年生藤本，長達10米，全株被黃褐色粗毛。塊根肥厚。葉互生；具長柄；3出複葉，頂端小葉的柄較長，葉片菱狀圓形，有時有3波狀淺裂，先端急尖，基部圓形，兩面均被白色伏生短柔毛，下面較密；側生小葉較小，偏橢圓形或偏菱狀橢圓形，有時有2～3波狀淺裂。總狀花序腋生，總花梗密被黃白色絨毛；花密生；苞片狹線形，早落，小苞片線狀披針形；蝶形花藍紫色或紫色，長15～19厘米；花萼5齒裂，萼齒披針形；旗瓣近圓形或卵圓形，先端微凹，基部有兩短耳，翼瓣狹橢圓形，較旗瓣短，通常僅一邊的基部有耳，龍骨瓣較翼瓣稍長；雄蕊10，兩體(9+1)；子房線形，花柱彎曲。莢果線形，扁平，密被黃褐色的長硬毛。種子卵圓形而扁，赤褐色，有光澤。花期4～8月。果期8～10月。

蕨根，多年生草本。根莖長，粗壯，匍匐，地下，被茸毛。葉柄疏生，粗壯直立，長30-100cm，裸淨，褐色或稈黃色，葉呈三角形或闊披針形，革質，3回羽狀複葉，長30-100cm，寬20-60cm;羽片頂端不分裂，其下羽狀分裂，下部羽狀複葉，在最下部最大;小羽片線形、披針形或長橢圓狀披針形，多數，密集;葉軸裸淨;葉脈多數，密集，通常叉狀分核，中脈被毛。孢子囊群沿葉緣著生，呈連續長線形，囊群蓋線形，有變質的葉緣反折而成的假蓋。

區別很大。

1、從外觀及顏色看：葛根粉較細膩，外觀色澤潔白，越白越純，蕨根粉有白色和黑色兩種，白色較黑色更純正，從氣味及味道看：純正的葛根粉少量放入口中時，好的葛根粉即使在沒有加糖和蜂蜜的情況下，也能品嚐到淡淡的回甜滋味，沒有其它異味。蕨根粉聞起來會有種藥味。