工業蒸餾水和普通醫用蒸餾水區別是較大的，一般工業蒸餾水是符合工業用途，醫用蒸餾水是符合醫用的用途。

區別之一是對微生物含量要求不同，工業蒸餾水一般對微生物含量要求不高，有的不要求。醫用蒸餾水對微生物含量要求嚴格，微生物不能檢測出來。

區別之二是工業蒸餾水用的包裝物，工業蒸餾水用的包裝物是工業用的，從材質上說符合工業標準就可以了，醫用蒸餾水要求用的包裝物符合醫用耗材的要求，對包裝材料的包裝物要求不同。

區別之三是工業蒸餾水對資質要求不同，工業蒸餾水一般對自制要求沒那麼嚴格，如工廠冷凝水可以用就可以，但是，醫用蒸餾水要求可以溯源，必須要求醫用蒸餾水提供者可以追溯到醫用蒸餾水的生產廠家、供應商詳細的信息。以便出現問題及時能找到廠家喝供應商。

蒸餾水：就是將水蒸餾、冷凝的水。有時候為了特殊目的，在蒸前會加入適當試劑，如為了無氨水，會在水中加酸；低耗氧量的水，加入高錳酸鉀與酸等。

工業蒸餾水是採用蒸餾水方法取得的純水，一般普通蒸餾取得的水純度不高，經過多級蒸餾水，出水才可達到很純，成本相對比較高。