首先是防浪護堤。紅樹植物能夠穩穩紮根於灘塗上，在海岸形成一道密實的天然屏障，是中國南方萬里海疆的第一道防護林，具有巨大的防災減災作用。紅樹林還可加速灘地淤高和向海伸展，使海灘面積不斷擴大和抬升，從而達到鞏固堤岸的效果。

其次，紅樹林具有淨化環境的功能，包括大氣淨化功能、水體淨化功能和土壤淨化功能。單位面積的紅樹林沼澤溼地固定的“碳”，是熱帶雨林的10倍。紅樹林還可以大量吸收重金屬、有機氯農藥等。

另外，紅樹林溼地見證了地球上海陸變遷的全部過程，是研究生物進化和海陸變遷的理想對象。比如紅樹林中的海蛙，是唯一能夠生活在海水中的蛙類，在研究大陸變遷及如何適應海洋環境方面具有重要意義。再比如，彈塗魚在身體結構及生活習性上具有海陸兩棲性，是研究魚類向兩棲類進化的重要對象。根據紅樹植物花粉，還可以進行地層對比，判斷濱海相沉積，推斷海岸線變化，恢復古氣候和古地理，在海洋地質勘探中具有重要作用。