很久以前敦煌一帶是一望無際的戈壁灘,既沒有鳴沙山,也沒有月牙泉。有一年敦煌遇到百年不遇的大旱,樹木莊稼都乾枯而死，百姓也因乾渴難耐而悲聲哭泣。

有一位美麗善良的白雲仙子路經此地,聽到哭聲心如割,同情地掉下眼淚。淚珠落地之處化為一窪清泉,使百姓們得到了救命水。就是月牙泉

為感恩戴德百姓們修建了一座廟宇供奉白雲仙子。誰知此舉惹怒了神沙觀裡的神沙大仙,他抓起一把黃沙填埋了清泉,想趕走奪去他香火的白雲仙子。白雲仙子自知道行淺,鬥不過神沙大仙,就到天上找嫦娥借月亮與神沙大仙鬥法。

這天正好是初五,白雲仙子把借來的月亮放入沙山中間,頓時月亮化做一彎清泉。神沙大仙聞之又去用沙填月牙泉,結果激怒了嫦娥,她輕輕將衣袖一拂,頓時沙山間大風四起,把填泉的流沙全都吹回了山頂。氣得神沙大仙吼聲如雷，沙山因此而鳴響。

傳說，敦煌有一座雷音寺。佛祖釋迦牟尼賜予雷音寺住持一碗聖水，希望他可以幫助人們消病除災。

此時，一個術士想要挑戰方丈，帶來了漫天黃沙，直接將雷音寺埋在沙底，但這碗聖水卻安然無恙。

聖水為了拯救百姓，懲罰術士，于是碗中泉水湧出來形成了月牙泉。