泡沫箱養魚可以使用生物過濾和機械過濾來過濾。
生物過濾是指讓有益細菌生長在過濾材料上，利用細菌來分解魚糞和食物殘渣等有機物質，將其轉化為無害物質。
機械過濾則是指通過物理篩選、過濾的方式，將懸浮在水中的顆粒物、魚糞等有機物質以及雜質過濾出去。
同時，也可以結合使用化學過濾，即通過投放化學藥劑來去除水中的廢物、異味和有害物質。
選擇何種過濾方式主要視魚缸種類、魚只數量以及水質等因素而定。
在進行過濾時，需要注意過濾材料的選擇、更換週期以及魚缸水循環的流速等相關問題。
同時，也可以使用氧氣增氧來促進好菌生長，提高水質，保持魚缸的清潔衛生。

可以

用泡沫箱最好養金魚、錦鯉一類的冷水魚，找個容積適宜的泡沫箱，安裝合適規格的過濾設備、器材及增氧設備，如果養熱帶魚的話還需要加恆溫棒，為避免加熱棒因不慎操作燙壞泡沫箱，故需不要將加熱棒安放在直接接觸泡沫箱的地方，可採用石塊等物品踮起。等泡沫箱內水體清亮、溫度適宜後就能養魚了。

活性炭過濾器

泡沫箱養魚用的過濾器一般是活性炭過濾器,它可以有效地去除水中的有害物質,如氨氮、硫化物等,從而保持水質的穩定。