中國目前農業生產上常用的農藥單劑近百種，蔬菜生產常用的殺蟲劑、殺菌劑、除草劑就達40多種。瓜類生產應有選擇地使用高效、低毒、低殘留的化學農藥。

①殺蟲劑：阿維菌素系列，包括除蟲菊酯類、植物提取物類、昆蟲激素類、少數有機磷農藥以及其他的農藥如殺蟲雙、吡蟲啉等。

②殺菌劑：包括多菌靈、託布津、加瑞農、克露、大生、波爾多液、農用鏈黴素等。

③除草劑：氟樂果、乙草胺、都爾等。

在南瓜生產中，嚴格禁止使用甲胺磷、呋喃丹、殺蟲啉、氧化樂果、三氯殺蟎醇、甲基1605、除草脒等農藥。

南瓜體內農藥殘留量與最後一次施藥距採收時間的長短關係密切。間隔期短，則農藥殘留量多；反之則少。因此，生產者一定要嚴格掌握各種農藥的安全間隔期。一般生物農藥安全間隔期為3～5天，有機磷農藥為7～10天，殺菌劑除百菌清、多菌靈要求14天以上外，其餘均為7～10天。