將過氧乙酸原液稀釋到0.3%-0.5%才可以消毒使用，例如,15%的過氧乙酸加50倍的水,稀釋到0.3%才能用於消毒。

將濃度為0.2%～0.5%的過氧乙酸溶液裝入噴霧器中噴霧消毒。泥土牆吸液量為50毫升/平方米～300毫升/平方米，水泥牆、木板牆、石灰牆為100毫升/平方米。對上述各種牆壁的噴灑消毒劑溶液不宜超過其吸液量。地面消毒先由外向內噴霧一次，噴藥量為200毫升/平方米～300毫升/平方米，待室內消毒完畢後，再由內向外重複噴霧一次。以上消毒處理，作用時間應不少於60分鐘，然後打開門窗通風。

房屋經密閉後，用濃度為15%，用量為每立方米空間7毫升的過氧乙酸溶液(1克/立方米)，放入瓷或玻璃器皿(可以用於加熱的)中，用酒精爐或燃氣爐加熱蒸發，薰蒸120分鐘，即可打開門窗通風。或用濃度為2%的過氧乙酸溶液(8毫升/立方米)噴霧消毒，保持時間應當為30分鐘～60分鐘，然後打開門窗通風。