11 月 22 日，針對 GMT Research 做空報告中的指控，飛鶴短暫停牌並在官網上發表宣告稱，公司強烈否認 GMT 報告中的指控，正在積極準備相關材料予以迴應。本著為廣大投資者負責的態度，公司申請臨時停牌，以最大限度保護投資者的利益。

11 月 21 日，在飛鶴上市不足 10 天之際，GMT Research 機構釋出了針對飛鶴的做空報告。該報告的指控主要集中在以下四個方面：一、該機構認為飛鶴手握大量現金，但是在過去五年並沒有過任何派息，猜測是有一部分現金或為捏造。二、該機構認為，未找到非常令人信服的理由來解釋飛鶴近幾年快速的增長；三、該機構表示，飛鶴招股書顯示，此次上市募集的資金用途是用來償債務，但是此前並未發現飛鶴將現金匯入香港作為股息或者債務償還；四、對於估值及利潤增長，該機構依然質疑其業績的可持續性增長，並且認為利潤率高於同行企業，認為 17 倍的市盈率更現實，也提醒投資者注意。

對此，飛鶴迴應稱，公司強烈否認該報告的所有指控，正在積極準備相關證明材料予以迴應。屆時將刊發澄清公告，請廣大投資者以公司公告為準。

針對這一事件，飛鶴董事長冷友斌在公司內部信中表示，GMT Research 的這些指控毫無根據、惡意中傷，堅決不能容忍，堅決予以反擊。以下為內部信全文：

據了解，GMT 最初是由一位分析師而成立的會計研究機構，後因常常活躍在港股、美股大力做空一些中概股而多戰成名。這家公司曾經沽空的公司有 58 同城、京東、中國交建、中國中藥、國藥控股、安踏等，皆為相關行業龍頭公司。

高階乳業分析師宋亮表示，GMT Research 做空報告內容較水，短期對飛鶴影響不大。但從長期來看，被沽空機構盯上的飛鶴不排除遭到更多的沽空，公司需要建立內部的反沽空機制。