男性生殖系統感染特別是慢性感染常較難治癒，且容易復發，主要原因有以下幾點：

①男性生殖系統與泌尿系統在解剖學和功能學上密切相關，其感染常與泌尿系感染並存，兩者可以互為因果關係。

②男性生殖系統中存在許多抗菌藥物較難滲透的屏障，如前列腺包膜為一層類脂膜，許多藥物不易滲透進入前列腺組織中，難以達到有效的殺菌濃度；血-睪、附睪屏障可防止細菌及毒物進入睪丸、附睪，同樣也可阻止藥物滲透至其中。

③由於抗菌藥物的廣泛應用，細菌可透過基因突變或質粒介導不斷產生新的耐藥菌株，使人們在開發和應用敏感抗菌藥物方面不斷面臨新的挑戰，亦成為男性生殖系統感染較難治療的原因之一。因此，在治療男性生殖系統感染時，首先要選擇致病菌敏感的抗菌藥物；其次要考慮抗菌藥物在尿中濃度，能否有效控制泌尿道感染，以及藥物對男性生殖器官組織的穿透能力。同時，用藥的療程要適當延長。

引起男性生殖系感染的病原菌常與尿路感染一致，大腸埃希菌是最常見的致病菌。但淋菌性尿道炎及淋菌性前列腺炎的病例正不斷增加，過去較少見的細菌感染也有升高趨勢，如變形桿菌、糞鏈球菌、沙雷菌、產氣桿菌以及院內感染菌屬——銅綠假單胞菌和克雷伯桿菌。此外，還發現有專性厭氧菌感染者。隨著檢驗水平的提高，近年發現解脲支原體和沙眼衣原體已成為生殖系統非細菌性感染的重要病原體。另外，由於抗菌藥物的廣泛應用，新的耐藥菌株在不斷地產生，因此有必要進行恥骨上穿刺尿培養或導尿培養，前列腺液、精液培養以及藥物敏感試驗，以明確引起感染的病原體種類，選擇敏感的藥物，以取得滿意的效果。男性生殖系感染可為單一菌種感染，亦可為多種細菌的混合感染，一般採用一種抗菌藥物治療，必要時也可聯合應用抗菌藥物。

綜上所述，選擇男性生殖系感染抗菌藥物必須是病原體敏感、離解度高、與血清蛋白結合力低的藥物，尚應注意藥物在不同pH環境下的抗菌活性問題。目前較常用的有頭孢類、喹諾酮類以及四環素類抗菌藥物。

頭孢菌素類是高效廣譜抗生素，其肝、腎毒性低，過敏反應小，已被臨床廣泛應用。第一代頭孢菌素對青黴素酶穩定，如頭孢拉定(cefradine)、頭孢氨苄(cefalexin)、頭孢唑林(cefazolin)、頭孢噻吩(cefa-lothin)等，但仍為許多革蘭陰性菌產生的β內醯胺酶所破壞，因此主要用於耐青黴素的金黃色葡萄球菌和某些革蘭陰性菌的泌尿道感染，其應用受到一定限制。第二代頭孢菌素對多種β內醯胺酶穩定，其抗菌譜較第一代廣，但對某些腸桿菌科細菌和銅綠假單胞菌的抗菌活性較差，常用的有頭孢呋辛(cefuroxime)、頭孢呋辛酯(cefuroximeaxetil)、頭孢孟多(cefamandole)等。第三代頭孢菌素對多數β內醯胺酶穩定，對革蘭陰性菌的抗菌活性甚強，其中一些對銅綠假單胞菌有良好作用，常用的第三代頭孢菌素有頭孢噻肟(cefotaxime)、頭孢噻甲羧肟、頭孢哌酮(cefoperazone)、頭孢曲松(ceftriaxone)等。頭孢類抗生素多經腎排洩，尿中濃度常高於血清濃度，對大多數泌尿系感染有效，第二代頭孢菌素中頭孢呋辛和頭孢呋辛酯以及多數第三代頭孢菌素能較好穿透進入前列腺組織及塞丸組織，常用於控制男性生殖系感染，頭孢菌素類對耐青黴素的淋病奈瑟菌有效，但對無細胞壁結構的衣原體及支原體感染無效。

喹諾酮類是人工合成的抗菌藥物，特別是加氟後的喹諾酮類藥物抗菌譜廣，抗革蘭陰性菌活性強，對許多耐藥菌株及銅綠假單胞菌有良好的抗菌作用，對革蘭陽性菌也有良好的抗菌活性。該類藥物在體內分佈廣，蛋白結合率低，多經腎排洩，尿濃度高，對前列腺組織穿透力強，不良反應較小，是較理想的男性生殖系抗感染藥物。據研究，喹諾酮類藥物在前列腺組織中的濃度常高於血清濃度，其在前列腺液中的濃度與血清濃度之比分別為：莫西沙星(moxifloxacin)1.6.依諾沙星(enoxacin)1.35,環丙沙星(ciprofloxacin)0.67，洛氟沙星(norloxacin)0.34，已被認為達到了前列腺炎的治療濃度。一般認為，喹諾酮類對細菌性前列腺炎的有效率為50%~90%。

廣譜青黴素類和氨基糖苷類抗生素可能對部分泌尿系感染有效，由於其為水溶性、耐藥菌株不斷增加、對男性生殖器組織穿透力差，較少用於男性生殖系的感染。

磺胺類是傳統的男性泌尿生殖系抗感染的有效藥物，能抑制大多數革蘭陽性、陰性菌及衣原體。口服吸收迅速，脂溶性高，穿透性好，有研究表明TMP在前列腺組織中的濃度是血清濃度的2~3倍，但其實際療效並不令人滿意。有人認為可能與甲氧苄啶(TMP)穿透至前列腺腺泡及導管的能力較差，較難控制腺泡與導管的感染有關。磺胺類藥物不良反應較大、過敏反應較多，目前已較少被採用。

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