功能性飲料其實是由運動飲料衍生而來的，因口感清新，頗受喜愛。但因這類飲料裡頭添加了不少的焦糖色素、檸檬酸、香料、乙醇、丙二醇、著色劑胭脂紅色素、苯甲酸鈉、對羥基苯甲酸等 ，加上新增的營養素也過多，其實不一定對人體有好處，所起的作用有可能會影響身體。

功能飲料是指通過調整飲料中天然營養素的成分和含量比例，以抗疲勞和補充能量為宗旨，以適應某些特殊人群營養需要的飲品，適宜於特定人群飲用，以調節機體的功能。故而對於功能性飲料，應三思而後“飲”。

富鉀和富鈉的功能飲料，可能會增加心臟負擔，心腎功能不好的人，應避免飲用，以防引發併發症或加重病情；若是平時活動量或運動量不大的，亦應避免飲用，以免出現體內鉀鈉離子偏高的現象，過度飲用或長期飲用極易出現高鉀高鈉血癥或血壓變化等。

富含咖啡因的功能飲料，飲用過多、下午飲用或晚上喝可能會引發失眠、引起焦慮抑鬱等症候。

過量飲用或長期飲用，可能會導致視神經腫脹，從而會引起視力下降而損傷視力。

功能性飲料裡的防腐劑，可能會因過量飲用或長期飲用，在體內體內，而影響身體或損害健康。

功能性飲料因所含能量較高或相對偏高，長期飲用可能會對身體會造成能量過剩或體重增加、容易發胖；兒童長期飲用能量飲料還可能會因飲料中的糖分抑制了攝食中樞，從而影響食物的消化與吸收，易造成營養不良、影響身體的正常發育或損害牙齒等。

因此功能性飲料需酌情慎飲、儘量避免給兒童飲用；某些慢性病患者或心肺肝腎功能欠佳者應酌情慎飲、少飲或忌飲；胃腸功能欠佳者、食慾不好的或孕婦都宜慎飲、少飲或忌飲。