依據一份發表在歐洲預防心臟病學雜誌上的研究，黑巧克力對心臟健康有益。

該研究顯示，巧克力可以保持心臟血管的健康。其中含有對心臟健康有益的營養物，比如黃酮類，多酚類，以及硬脂酸。這些物質可以減輕炎症，增加有益的膽固醇。巧克力富含抗氧化劑，可以幫助減輕炎症，改善血流，振奮情緒，提高注意力。

可可豆類的產品比大多數食物含有更多的植物性抗氧化劑和原花青素。原花青素可以阻止有害膽固醇的攝取。

巧克力中的抗氧化劑可以維持其功效至少50周，而可可豆以及可可粉中的抗氧化劑可以保持穩定長達75年之久。綠茶中也含有抗氧化劑，但在儲存期內會降解。

該研究回顧性查閱了過去50多年的研究，發現每週吃巧克力超過一次與冠狀動脈疾病的患病風險降低8%有關聯性。

早期的研究也印證了這種益處。攝取可可類食物與冠心病發病率顯著降低以及任何因素造成的死亡率顯著降低有關聯性。它可以阻止血管壁內的斑塊形成，並可以降低血壓。有助於預防中風和心衰。

巧克力與改善大腦血供也有關，可能有助於改善認知功能。在健身的時候巧克力可能增強體內氧氣的運輸能力。但有研究顯示，巧克力對面板健康不利，與面板痤瘡的發病有關聯。

巧克力的顏色越暗，其中的可可含量越高。但是，如果黑巧克力被生產者進行了深加工，其對人體健康的益處會下降。應選擇沒有被鹼中和其所含天然酸性物質的可可粉。這種處理方法通常被稱為荷蘭工藝（Dutch processing）。

與白巧克力相比，黑巧克力所含的糖以及熱量更低。吃適量的巧克力似乎可以保護冠狀動脈，但大量的攝入會適得其反。可以在飲食中加入其它富含黃酮類的食物，比如蘋果，茶，柑橘，洋蔥，漿果類（葡萄，番茄等）。

常見的巧克力商品中含有熱量，糖，奶，以及脂肪，對糖尿病和肥胖患者健康不利。