上文說到上官婉兒墓被損毀嚴重，那麼究竟是誰要毀了她的墓，為何要毀，出於什麼目的？

在上官婉兒墓的北部接近墓室的位置，存在一個非常明顯的大型擾抗痕跡，根據墓室被毀的嚴重程度來看，考古領隊李明排除了盜墓賊所為的可能，初步判定為官方毀墓，因為盜墓的動機很單純，珍貴文物他盜出去即達到目的，他絕不會多此一舉去毀壞墓室。而毀墓不一樣，他的動機完全是政治性的，要對墓主人顯示一種政治上的否定和一種懲罰。

那麼究竟是誰要打擊上官婉兒的政治立場呢？有人認為上官婉兒之後的家族犯錯，因此被掘了祖墳，武則天就曾將唐初名將李積從墳墓中挖出來挫骨揚灰，原因就在於他的子孫隨徐敬業造反而受牽連。還有人認為遭受溫韜之亂，唐末之後的五代十國有一個叫溫韜的節度使，幾乎掘開了關中地區所有的唐朝皇陵，上官婉兒墓是否也毀於溫韜之手呢，墓誌中會有毀墓的線索嗎？

墓誌中一共提到了三個人：睿宗皇帝、太平公主、皇太子。皇太子就是李隆基，當時剛當上皇太子一個月左右。這三個人的關係是非常微妙的，唐隆政變後李隆基的父親相王李旦登上了皇位，史稱唐睿宗，因為發動政變有功太平公主晉封萬戶，其權勢達到了唐朝公主之最，而當初那個小小的臨淄王李隆基，也從老三的位置一躍成為皇太子。迅速崛起的兩人，馬上成為了政治上的競爭對手，而唐隆政變則是姑侄倆矛盾激化的源頭。在太平公主這一方，她認為自已被侄子算計了，咱倆本來一起搞政變，但是你卻殺了我的人（上官婉兒），你到底什麼意思？你這不是明擺著要斷我後面的路嗎？所以後來太平公主和李隆基馬上進行了爭權奪利的鬥爭。在這個鬥爭中，上官婉兒是一個很重要的焦點。

從太平公主給以上官婉兒超規格的墓葬以及墓誌的行文措辭來看，太平公主想以上官婉兒的死來借題發揮，向李隆基表達自已的不滿情緒，所以墓誌全文充滿著溢美之詞，藉以說明李隆基的不仁不義和濫殺無辜，從而達到打擊李隆基聲望的目的，這也是上官婉兒迅速獲得平反的真正原因，也是太平公主用超規格的葬禮安葬上官婉兒的真實目的。

唐睿宗時期太平公主與李隆基二人的權力極大，睿宗每遇到重要國事都要徵詢二人的意見之後方能做出裁決，然而兩人的爭鬥十分激烈，睿宗曾試圖在二人之間尋求政治平衡，但最終沒能成功。作為一代女皇武則天的女兒，太平公主遺傳了母親的政治基因和政治野心，甚至一度有壓倒李隆基成為第二女皇的可能。最後在公元712年，無可奈何的唐睿宗只好傳位於太子李隆基，這就是後來開元盛世的締造者唐玄宗。

而此時的太平公主並未放棄對皇位的爭奪，第二年她企圖發動政變廢掉李隆基。得知訊息後李隆基隨即先下手，發動先天政變誅殺了太平公主及她在朝廷以及宮中的親信。聯想到之前被太平公主高調平反的上官婉兒，於是李隆基下令把她的墓毀掉。太平公主敗亡後被抄家問斬，其黨羽也被誅殺殆盡，甚至連死去的上官婉兒也未得到片刻的安寧，作為一種政治報復手段，挖掘墳墓挫骨揚灰，才能一解李隆基的心頭之恨。只可惜的是上官婉兒，成了這場權力爭鬥的犧牲品，她死於李隆基的刀下，而當太平公主失敗之後，李隆基又借用毀掉她的墓葬來達到徹底剷除太平公主勢力的政治目的。

至此上官婉兒墓葬被毀之謎，終於真相大白。而遺憾的是，上官婉兒的遺骨始終沒有發現，所以人們想一睹上官婉兒容貌的願望也無法實現了。最後，經過考古結束後的上官婉兒墓被回填，建起了一座上官婉兒墓遺址公園。