獲勝後，李世民對薛仁杲和薛秦的將士們都不錯，回程的路上完全沒有表現出什麼猜疑的意思，這些人也都表示願意歸附到他的手下。但是讓他驚訝的是，回到長安後，李淵卻對他說：“薛舉父子殺死了我們許多士兵，我一定要把他們全部誅殺，告慰我軍英靈。”李世民對著父親不敢說什麼，倒是另外一個人站出來阻止了李淵的念頭。

先把目光重新拉到當初北上的宇文化及身上，山東地區盜匪雖然多，可是沒有很成氣候的，宇文化及十萬官軍精銳，不是這些盜匪能夠抗衡的，使得宇文化及拉著這一大些人輕輕鬆鬆的穿過了山東地區，途中還有造反者中名聲很大的王薄前來投靠，大概是他認為宇文化及誅殺昏君，是給人民出氣，所以將有很好的前程就去投奔。

實際上，那些原來起兵反抗隋朝的人，在這個時候卻突然轉變了口風，說宇文化及弒君，屬於亂臣賊子一列，號召大家來討伐他。北方最大的兩股“亂軍”，竇建德對自己的手下說：“我當隋朝的百姓都好幾十年了，隋朝作為我的君主兩代人了。宇文化及這小子居然弒君，這大逆無道之舉，我將他視為我的仇人，願意和諸位一起討伐他，你們覺得如何？”他說的大義凜然，一個屬下在邊上說出了他的心思：“海內沒有主人，英雄競相逐鹿，大王布衣出身，隋朝郡縣官吏都爭相來歸附，正是因為大王以順討逆，有仗義的名聲。宇文化及是皇親國戚，全家深受國恩，做出這種事情，正是天下賊寇，討伐他，可以讓我們有更好的名義號召天下。”竇建德連聲稱善，釋出檄文討伐宇文化及，河北地區許多正在和起義軍交手的隋朝官員，見隋朝大勢已去，竇建德這人似乎不錯，都來投奔，讓竇建德短時間內獲得了大量的助力。而李密做的更乾脆，他直接接受了東都小皇帝的冊封，成為了隋朝的一名官員，還有了一個迎擊宇文化及的新任務。不過竇建德是主動而為，李密這麼做卻是逼急無奈。隋煬帝死後，東都有了新皇帝和“七貴”，七個人裡面王世充掌握兵權，對其他人不理不睬，做事情專橫跋扈，那些人與小皇帝都想除掉王世充，可他們沒有足夠的力量，就想到了在城外擁兵數十萬的李密。小皇帝封李密為太尉、尚書令，並下詔等李密平定宇文化及之後就可以進入東都成為輔政大臣。李密在中原沒有一個足以支撐自己大軍的根據地，宇文化及過來，他又不能放過，萬一這小子佔據中原和他作對咋辦，可如果不放過，那李密就要面臨王世充和宇文化及兩面夾擊的局面，這還真不是他能夠憑藉自己的力量應付的，所以第一個釋出討伐隋煬帝檄文的李密又成為了隋朝的官員，領著中原最大的起義軍瓦崗軍，去討伐殺死隋煬帝的宇文化及去了。

兩支部隊在黎陽附近遇上，李密和宇文化及隔水對峙，李密朗聲道：“你這廝原本是匈奴人奴隸，姓破野頭的家奴，祖上受人恩德免於做奴隸，你自己的父子兄弟受隋朝恩德幾十年，富貴到了極點。陛下無德，你不能勸諫，反而弒君，真真是天地不容。你還想往哪裡去？趕緊過來投降，我還可以饒你一命。”宇文化及支吾半晌，道：“今天打就是了，囉嗦什麼。”李密嗤笑一聲，對身邊人說：“宇文化及如此愚笨，還想要做皇帝？真是可笑，我就算折一根杖子都能打敗他了。”他探聽到宇文化及遠道而來，糧草不足，便就地紮下營寨，不肯出擊，要等宇文化及糧草吃光自行崩潰。

訊息沒錯，宇文化及一路上劫掠了許多，吃掉了許多，糧草卻是供應不足，而擺在眼前的，是糧食充足的黎陽倉，宇文化及命全軍整修攻城器具，要攻打城池。

鎮守黎陽倉的是徐世績，他在城外挖掘了很深的護城河，讓宇文化及的攻城器具無法越過，只能在護城河邊上擺擺樣子，士兵們忙著去把護城河填上再攻城。徐世績從城下挖掘了地道，潛出城去，縱火燒掉了宇文化及好大一塊營帳，還將他所有的攻城器具付之一炬。沒有了攻城器具，宇文化及就不可能再攻打黎陽倉，他就開始想要撤退。李密又坑了他一次，送去書信，約他十天後決戰，宇文化及回書同意後，認為十天後就勝負已定，宣佈軍中，取消了之前限制發放糧食的政策，讓士兵們敞開懷使勁吃，保持充沛的體力。就這麼過了幾天，等到決戰那日，宇文化及吃驚地發現李密完全沒有決戰的意思，瓦崗軍還是縮在城中和營寨中，一丁點沒打算出動。宇文化及氣瘋了，帶著部隊攻了上去，又被對方頂了回來。