日本人到底是不是徐福帶去的童男童女所生的後代，這在史學界沒有確論，有些人說是，因為徐福帶去的人確實在日本住下。但問題是，3萬年以前，日本列島上就被確認過有人類生存的歷史，而徐福去日本的中國秦朝時期，日本已經有了像模像樣的國家，如奴國。

徐福懂得煉丹之術，也是個聰明人，他當然知道長生不老藥是不可能煉出來的，所以一直都在欺騙秦始皇，徐福對始皇帝說東方有仙山，名曰蓬萊，（也就是現在的富士山）。始皇帝龍顏大悅就賞賜給他大量的金錢，讓他東渡蓬萊，徐福東渡歸來，卻沒帶回長生藥，說仙人嫌棄禮物少，秦始皇信以為真。童男童女再多，也無法與健壯成年人的體力相提並論，尤其是遠航過程中需要人力操縱船隻，而且如果真的成功抵達日本島，或乾脆就是一座陌生的島嶼，首要問題是先安頓，建造住所，開墾糧田，人力自然必不可少。

現在在日本很多的地方都供奉著徐福的雕像，每到節日的時候，會用他的雕像來求雨，人們稱呼他為“雨神”，還有說法認為徐福是日本的第一任天皇，神武天皇。日本的文獻記載，日本的天皇是從別處飛來的，這個情況非常符徐福東渡的情況。日本有一座徐福公園，是當地人為了紀念徐福而修建的，而日本的一位親王也曾經公開說自己就是徐福的後代，可憐確實有一些依據的。