皇太極把聯姻當做籠絡蒙古貴族的政治手段，以達到合作結盟的目的。崇德元年（1636年）四月，皇太極正式由汗位改稱皇帝，稱“寬溫仁聖皇帝”，定國號為“大清”，族名滿洲，改元為崇德元年。皇太極為什麼改國號為“大清”呢？傳聞說，他的父親努爾哈赤早年逃難時騎著一匹大青馬，因為日夜趕路不休息，他的馬被活活累死了。努爾哈赤很是難過：“大青啊，大青，將來我得了天下，國號就叫大清！”所以，皇太極改國號、稱皇帝，就是為了表明：自己不僅是滿洲的大汗，而且是蒙古人、漢人以及所有人的大汗，是大清國臣民的皇帝。

也就是在那天，後金軍正式被改為清軍。之後，皇太極封多爾袞為睿親王，多鐸為豫親王，阿濟格為英郡王，豪格為肅親王。同年七月，皇太極又定五宮制，中宮為清寧宮皇后（大福晉博爾濟吉特氏），東宮為關雎宮宸妃（即海蘭珠）、次東宮為麟趾宮貴妃、西宮為衍慶宮淑妃、次西宮為永福宮莊妃。這“一後四妃”，都是蒙古族人，都姓博爾濟吉特氏，分別屬於蒙古察哈爾部和科爾沁部。聯姻是皇太極提出的，於是他想要以身作則，將自己的次女固倫溫莊長公主下嫁給了林丹汗的兒子額哲，並命令長子豪格和二兄代善、七兄阿巴泰分別和蒙古察哈爾部聯姻，化敵為友，化仇為親，構成錯綜複雜的姻盟，以達到聯合蒙古的目的。

皇太極還特別重視農業生產。他在位期間，提出了“四個禁止”：禁止妨礙農業生產的建築工程，禁止屠殺牲畜，禁止滿人擅取漢人財物，禁止放鷹糟蹋莊稼。此外，他還實行了“三丁抽一”政策。何為“三丁抽一”？指的是一家三丁，一人出去打仗，兩人留下從事生產，以保證勞力。正是這些措施，發展了農業生產，也使後金經濟有了很大改善。

此外，皇太極還重視風俗習慣的改革，使族眾觀念得到了大解放。滿洲曾有亂倫的婚俗：比如，嫁娶不擇族類，父死，子可娶後母；兄死，弟娶嫂子等。皇太極決定改革滿洲的婚姻習俗，並提出了這樣的規定：永遠禁止娶繼母、伯母、叔母、兄嫂、弟婦、侄婦……