導言：本文將從上文也速迭兒殺死北元末主脫古思帖木兒及其剩餘家族後，去元朝帝號開始到其家族被滅為止， 講述大元亡國後，最初幾十年紛亂而血腥的歷史。本文將講述1388年也速迭兒推翻北元皇位到1408年篡位者鬼力赤被殺這20年的歷史。
大元的滅亡公元1388年，藍玉率軍攻入捕魚兒海（貝爾湖），俘虜脫古思帖木兒次子地保奴及妃主五十餘人、渠率三千、男女七萬餘，馬駝牛羊十萬，以及大量印章、圖書、兵器、車輛。並強姦脫古思帖木兒的妃子。脫古思帖木兒落荒而逃，半路上遇到了也速迭爾的軍隊。也速迭爾是曾蒙古守舊勢力代表阿里不哥的後裔，阿里不哥曾和“勾結漢人”的忽必烈爭位失敗而死。算起來也是復九世之仇。於是也速迭爾抓住脫古思帖木兒，用弓弦勒死，並將其剩餘家人全部處死。
脫古思帖木兒的去世使的合法的元朝皇帝已不復存在，也讓黃金家族-忽必烈家族喪失了在蒙古人中至高無上的的地位，大多數蒙古部落因此宣佈脫離黃金家族而獨立，蒙古各部又回到了爭奪蒙古帝國大汗寶座的紛爭當中。
也速迭爾自命為蒙古卓裡克圖汗，不再自稱元朝皇帝。 而也速迭爾的勢力範圍並不是蒙古本部，也就是蒙古高原和東部地區，而是西部的衛拉特蒙古地區，也就是瓦剌。雖然也速迭爾屬於阿里不哥一脈。但是他已經是瓦剌貴族的傀儡。原脫古思帖木兒的部眾大部分被強遷到西蒙古衛拉特地區。朝政開始由衛拉特貴族把持，這時，蒙古至少在表面維持著統一。1391年，也速迭兒去世，其子恩克繼位才四年就去世。
汗位紛爭洪武三年（1370年，至正三十年），李文忠等率明軍攻破應昌（今內蒙古克什克騰旗），俘虜元昭宗愛猷識理達臘之嫡長子買的裡八剌，押到南京後被明太祖朱元璋封為“崇禮侯”，1374年，明太祖以元昭宗“父子隔絕、未有後嗣”而將崇禮侯買的裡八剌遣還蒙古。 於是在1394年恩克汗死後，買的裡八剌繼任汗位，即尼古埒蘇克齊可汗。
但是他自身依舊陷入到瓦剌勢力的控制之下。買的裡八剌不得不重用瓦剌首領郭海太尉，並且引起瓦剌原來的君主鬼力赤的不滿。在一系列複雜的陰謀之後，買的裡八剌殺害了郭海太尉，自己也被鬼力赤和郭海太尉之子馬哈木聯起手來殺害。到了1400年，瓦剌完全控制了汗廷，明太宗朱棣發現新的可汗坤帖木兒同瓦剌王鬼力赤的權力幾乎相當。
梟雄鬼力赤作為蒙古最有權勢的人，他不僅殺了買的裡八剌，1400年還擁立了其長子坤帖木兒繼承汗位。不過這僅僅是一個過渡而已，鬼力赤在1402年正式殺了坤帖木兒自己稱汗。坤帖木兒的兒子本雅失裡投奔中亞帖木兒帝國，皈依了伊斯蘭教。鬼力赤奪得了大汗的寶座，稱韃靼可汗。鬼力赤嚮明朝示好、想得到明朝支援，引起了蒙古各部的不滿。
因為鬼力赤的生活完全不似蒙古人，他是隸屬於西蒙古瓦剌突厥系吉爾吉斯人首領。根本不配做蒙古大汗。當時蒙古本部最大的勢力，太師阿魯臺聯合瓦剌馬哈木等勢力，在1408年廢掉了鬼力赤，最後為阿魯臺所殺。迎回了本雅失裡接任汗位。
蒙古分裂在迎立新的蒙古大汗中，阿魯臺和馬哈木兩人成了蒙古汗國最有權勢的人，馬哈木的瓦剌部遊牧在西蒙古到西域一帶，就是後來明史中的瓦剌，基本不受蒙古汗國控制了。阿魯臺和其他蒙古部落圍繞在傀儡大汗周圍，被明朝稱為“韃靼”，也被現在的人習慣稱為蒙古本部。
二人雖然合力推翻了鬼力赤，但是對於蒙古統治權的爭奪從來沒有停歇。最後東西蒙古的爭鬥逐漸白熱化。在當時瓦剌實力相當強大，時稱“四萬衛拉特”。轄境除葉尼塞河上游外，還包括額爾齊斯河上游、科布多東南札布罕河流域等地。他們為同控制著汗位的東部蒙古貴族分庭抗禮，並進而稱雄於漠北，一面結好於明廷，遣使嚮明廷貢馬。一面又積極同東部蒙古統治集團進行鬥爭。
不過此時在長城以南，明朝皇帝對北部蒙古發生的事件一直虎視眈眈，當他看到瓦剌和韃靼正式決裂，打的難解難分的時候，正在盤算著將他們一網打盡。
下一章，我將介紹明成祖朱棣的北伐對蒙古部落的影響。