這次，李率領部下乘勝追擊，形勢相當危急，甚至連林肯都認為這次華盛頓必將失守。於是林肯下令，全體華府文武職員，一律全副武裝保衛首都，而運輸彈藥的船隻則集合在河邊待命。戰爭部長斯坦頓匆忙致電其他六州告急，要他們立即徵集民兵和志願兵支援戰場。

大小商鋪將大門緊鎖，教堂敲響警鐘，人們紛紛雙手合十跪在地上祈求上帝保佑平安；老幼婦孺驚慌失措，街上一片慌亂，戰馬疾馳而過，軍隊開向馬里蘭州。

斯坦頓下令要將政府機構轉移到紐約，於是命令將軍火庫及其一切後備武裝裝上船準備北上。財政部長則忙著將國庫內的金銀迅速轉移到華爾街的財務分署。

林肯呢？他陷入了深深的絕望，一個勁地喃喃自語：“我該怎麼辦？我該怎麼辦？盆子已經穿底了，盆子已經穿底了。”

人們紛紛指責麥克萊倫公報私仇，故意要波普一潰千里。於是，林肯召見麥克萊倫，說他已經被國民指為賣國賊，說他就是想要華府淪陷，要南方獲勝。斯坦頓則在戰爭部大發雷霆，並宣稱如果麥克萊倫此時走進戰爭部，一定會被自己撕個粉碎。就連厚道的蔡斯都恨不得蒙上麥克萊倫的眼睛，把他槍決。

林肯呢，仍然以其基督般的胸懷待人處世，他沒有指責任何人。波普的確失敗了，難道他不想成功嗎？林肯自身經歷的失敗夠多了，以至於他沒有辦法去責備別人的失敗。

最後，林肯將波普派往西北，平息蘇族印第安人的叛亂，同時下令再次召回麥克萊倫指揮聯邦國軍。這是為什麼呢？林肯回答說：“軍中再沒有人能像他那樣將軍隊操練得像模像樣了。雖然他實戰不行，但卻能訓練士兵讓他們樂意應戰。”

林肯知道，再次啟用麥克萊倫註定要遭受譴責，就像斯坦頓和蔡斯所說的那樣，他們寧可將華府拱手送給敵軍，也不願意再讓賣國賊指揮國軍。林肯被內閣的強烈譴責傷害到了，他甚至提出了辭職。

安蒂特姆戰役結束幾個月後，麥克萊倫再次拒絕執行林肯對他下達的追擊李的命令，結果，他的指揮權再次被剝奪，而他的軍事生涯也就此結束了。

必須另外找到一位領導人。但是，這個人在何方呢？沒有人知道。

林肯打算殊死一搏，將這一職位授予伯恩賽德。伯恩賽德知道自己無法勝任，拒絕了兩次任命，但最後他不得不哭著上了戰場。

倉促間，他在弗雷德裡克堡向李的防禦工事發起襲擊，結果白白折損了 13000 人。這導致軍中將士四處潛逃，伯恩賽德被罷免了，接替他的是另一位吹牛大王——“好戰的喬·胡克”。

剛上任的胡克立刻吹起了牛皮，說：“願上帝眷顧李，但我可不會眷顧他。”胡克自認為自己率領的軍隊是整個星球最棒的一支，其兵力是南部邦聯的兩倍。不過，李還是把他打跑了，還摧毀了他 17000 人的兵力。

這次戰役發生於 1863 年 5 月，是內戰以來最具災難性的一次挫敗。總統秘書記錄道，林肯那時候幾乎無休無眠，每天只知道在房間裡踱來踱去，還大喊：“完了！完了！全完了！”但到了最後時刻，林肯卻趕到弗雷德裡克堡，給喬·胡克和士兵們鼓舞士氣。

國民憤怒了，將矛頭紛紛指向了總統。

當戰爭陷入極度的敗局時，林肯的家裡也發生了悲劇。

當時最能安慰他的是兩個幼子，泰德和威利。在盛夏的夜晚，他會避開那些令人懊惱的國事與兒子們追逐嬉戲。有時候，他會追著孩子們從這間屋子跑到那間屋子；有時候，他跟孩子們玩彈珠射擊，從白宮一直玩到戰爭部辦公室。天黑了，他就滾在地上跟孩子們嬉鬧；陽光明媚，他有時會帶孩子們和山羊外出遊玩。

兩個孩子給白宮增添了許多生趣。他們對僕人進行軍訓，他們哄騙到白宮求職的人，讓這些人在白宮裡迷路。當然，如果他們喜歡哪位求職者，就會答應帶他去見總統。如果門衛禁止這些求職者進入，他們還會偷偷地將其從後門引進。

後來，威利得到一匹小馬駒，他喜愛極了，不管颳風下雨，他都會堅持遛馬，結果染上傷寒，一直高燒不退。那段時間，林肯都守護在兒子的床前，但最後他還是過世了。林肯幾乎窒息而死，哽咽道：“我可憐的孩子！我可憐的孩子！他太好了，不適合生活在地球。上帝召他回家去了。”