準噶爾汗國，是準噶爾部（衛拉特地區的一支）的首領噶爾丹於1676年打敗衛拉特盟主鄂齊爾圖汗之後，把鬆散的聯盟體制步步改變為集權的政權體制後建立的君主制國家。噶爾丹透過把準噶爾首領的臺吉地位上升為汗王地位，在1678年正式建立了一個汗國。1653年，巴圖爾琿臺吉去世，其第五子僧格繼承臺吉，但其眾兄弟不服，起兵反叛，內戰爆發，至十七世紀六十年代，僧格才平定了叛亂，但在1671年，他就被自己的兩個哥哥--車臣和卓特巴巴圖爾暗殺，他的三個兒子都年小，臺吉位難以得到延續，他的弟弟——正在西藏學習佛學的噶爾丹（僧格的同母弟）徵得老師五世達賴喇嘛的同意，還俗，快速回國，在和碩特首領兼衛拉特盟主的鄂齊爾圖車臣汗援助下，擒殺了車臣，並將卓特巴巴圖爾趕往青海。噶爾丹自立為準噶爾汗。噶爾丹首先統一了西蒙古諸部，隨後，他起兵進攻葉爾羌的黑山派和喀什噶爾的白山派，征服了這個察合臺汗國。1676年噶爾丹打敗衛拉特盟主鄂齊爾圖汗，把鬆散的聯盟步步改變為壟斷權力的汗國。1678年，噶爾丹出兵南疆，佔領葉爾羌汗國。1688年，噶爾丹突然率兵越過杭愛山，大舉進攻土謝圖汗，迫使喀爾喀蒙古諸部南遷。噶爾丹敗亡後，他的侄子策妄阿拉布坦繼任準噶爾部臺吉，準噶爾部又逐漸強大起來，與清朝再次發生衝突。1716年，準噶爾部出兵西藏，佔領拉薩。1718年，清朝由青海出兵入藏，全軍覆沒。1720年，清朝第二次出兵，趕走準噶爾軍。1755年，乾隆帝趁準噶爾內亂之機出兵進佔伊犁、擊潰達瓦齊軍。1757年，清軍平定阿睦爾撒納的叛亂，完全控制衛拉特區域，準噶爾汗國滅亡。準噶爾是和明朝對峙的瓦剌部，後來瓦剌部在崛起的蒙古韃靼部打擊下向西遷移併發生分裂，在歷史上又被稱為衛拉特部，下面又分為準噶爾部、和碩特部、土爾扈特部和杜爾伯特部四部，也稱為漠西衛拉特。所轄地區北至額爾齊斯河、鄂畢河、葉尼塞河上游地區，南至天山，東到阿爾泰山和蒙古杭愛山分界線，西包巴爾喀什湖地區。十七世紀，準噶爾部強大起來，將土爾扈特部向西壓迫，致其與杜爾伯特部、和碩特部的一部被迫遷到了伏爾加河下游地區。向東壓迫杜爾伯特部，奪其領地，逼其內附清朝。並企圖兼併和碩特部，入侵青海。準噶爾部又擊敗哈薩克人，翻過天山征服回部諸察合臺汗及伊斯蘭教派白山派與黑山派，飛兵拉薩，凌攝西藏，終於建立起了強大的準噶爾汗國。其疆域北接額爾齊斯河、鄂畢河、葉尼塞河上游，南到西藏阿里地區，西包巴爾喀什湖，東至蒙古薩彥嶺及色愣格河流域，極盛時達四百多萬平方公里。