17世紀中葉,沙俄侵略矛頭指向黑龍江流域。1643年冬,以波雅爾科夫為首的沙俄軍隊,竄入精奇裡達斡爾族地區。襲擊村落,蹂躪鄉民,掠奪糧食,侵略者的野蠻行徑,激起達斡爾人民的英勇反抗。他在們莫日迪齊城外,用弓箭、獵刀、長矛挫敗沙俄入侵者,殺敵10人,俘獲10人。首次給予侵略者以沉重的打擊。
順治七年(1650),哈巴羅夫匪徙又侵入黑龍江流域,立即在雅克薩遭到達斡爾族人民的痛擊。次年,哈巴羅夫夥,竄到達斡爾族的桂古達爾城。桂古達爾部落全體村民同敵人展開了一場浴血惡戰。在兩天一夜的鏖戰中,600餘名守城者,全部壯烈犧牲。譜寫了一曲保家衛國的悲壯讚歌。
順治九年(1652)4月,500名達翰爾人會同525名滿人,配合寧古塔章京巴海的清軍,取得烏扎拉戰役的勝利,給予入侵者以毀滅性的打擊。之後,哈巴羅夫道:“我們不知道怎樣過冬,不敢呆在結雅河口或松花江口的達斡爾利亞地區”。從此,侵略者的氣焰銳減。
順治十七年(1660),達斡爾人參加了由寧古塔總管巴海指揮的古法壇村戰鬥,消滅了斯捷潘諾夫殘部,基本上扼止了沙俄的勢力,使黑龍江出現安定局面。
康熙二十三年、康熙二十四年(1684~1685),達斡爾族官兵多次前往雅克薩偵察,為清軍圍剿雅克薩敵軍提供了重要情報,為收復雅克薩做出重要貢獻。康熙二十八年(1689),《尼布楚條約》的簽定,標誌達斡爾族同其它民族共同進行的反侵略鬥爭取得了勝利。
達斡爾族的遷徙:十七世紀中葉,清軍忙於對明作戰,無力北顧,決定將黑龍江以北諸族南遷。從此,達斡爾族陸續踏上背井離鄉的征程,南遷到嫩江流域。
達斡爾巴特恩部最先遷徙。17世紀30年代,其部居民在首領呼力口肯的率領下從黑龍江上游的多金城,遷到嫩江中、上游兩岸。自1649年到1651年,達斡爾族各部居民,經過千辛萬苦,大部分遷居在墨爾根、博爾多、齊齊哈爾等嫩江兩岸。清廷為了便於統治,將他們編為杜博淺、莫爾丁、納英丁3個“扎蘭”(隊),由理藩院管轄。
定居在齊齊哈爾廣闊平原上的達斡爾人,稱為齊齊哈爾達斡爾。他們以農業為主,兼營漁獵,同漢人雜居,文化比較發達。遷居在嫩江右岸諾敏河口一帶的巴特恩達爾各部,稱西布特哈達斡爾;遷到訥莫爾河一帶的原精奇裡部,稱東布特哈達斡爾。布特哈達斡爾以狩獵、畜牧為主,也稱打牲部。
康熙二十二年(1683),俄人犯境。次年,清廷調齊齊哈爾和東布特哈達斡爾官兵500人駐守璦琿。除後來一部分返回外,留下的集聚在富拉爾基和坤河村內,稱愛琿達斡爾。
康熙二十七年(1688)、康熙二十九年(1690),清政府分別從布哈特派遣1400名達斡爾、鄂溫克官兵到墨爾根駐防。他們在甘河口建置20多個村子。這部分達斡爾稱莫日思(墨爾根)達斡爾。
1732年,清廷從布特哈區調遣26佐達爾官兵去海拉爾駐防,稱海拉爾達斡爾。
乾隆二十八年(1763)—乾隆三十年(1765),清為平定準噶爾叛亂,遷調達斡爾,鄂溫克兵丁500人,組成索倫營,連同家屬去新疆伊犁。平定叛亂後,這部分達斡爾人留那裡,稱新疆伊犁達斡爾。
早在雍正十二年(1731),清廷就派遣部分達斡爾兵丁駐守呼蘭河一帶。乾隆年間…又陸續從齊齊哈爾遷調120戶達斡爾人到呼蘭河地區屯墾。稱之謂呼蘭達斡爾。
達翰爾族經過近百年的遷徙,從集中一地的民族,變成分散在不同地點的民族。