秦始皇為中國的歷史發展奠定了非常強大的基礎，軍事、政治上的成就也令人稱奇。但是，有關秦始皇的傳說和謎題也很多，尤其是關於秦始皇的身世問題更是到現在都沒有一個確切的答案。即使是史料中，也沒有找到完全確切的記載。

在目前的一些史料中，可以看到兩種記載。在秦始皇本紀上，記載道秦莊襄王的妃子趙氏生下了秦始皇，而這個妃子原本是呂不韋的舞姬。而另一種記載中寫道，一舞姬和呂不韋曾有一段關係，並且該舞姬有孕，但是後來卻被呂不韋獻給了莊襄王，最後生下了秦始皇。在這兩段記載中都有一個重複出現的關鍵人物，那便是呂不韋。

呂不韋當時是趙國的一個商人，身份低下，但是他一直想找機會提高自己的門第，從"賤"商中脫離出來。當他看到被送到趙國做質子的子楚時，便覺得自己的機會來了。他去拜見子楚，希望可以和他一起合作，共同提高他們的地位。子楚聽到呂不韋的提議之後，也同意和呂不韋聯手。於是，呂不韋出錢幫子楚四處遊說，子楚用自己"繼承人"的潛能幫呂不韋擺脫賤商地位。

若秦始皇真的是呂不韋的兒子，那麼以下的描述可能就是證據。據說一拍即合的兩人商談得非常投機，就這樣開始了密切的往來。子楚常常到呂不韋家中飲酒，有一次，子楚喝醉了，意外相中了呂不韋身邊的一個舞姬趙氏，甚至還想要輕薄她，不過當時的趙氏已有身孕。看到如此情景的呂不韋佯裝不悅，但是最後還是順水推舟將趙氏獻給了子楚。

呂不韋知道趙氏肚子裡的孩子是自己的，便有了更大的圖謀。而不知情的子楚自當自己奪人所好，再加上他接受了呂不韋良多幫助，心中有愧，更是對呂不韋深信不疑。最後，呂不韋的計劃成功了，子楚成功登基，也就是我們所說的秦莊襄王。在子楚登基之後，趙氏便生下了一個兒子，也就是秦始皇。

若按照這個故事，呂不韋才應該是秦始皇的親生父親。很多史學家也認為秦始皇很多性格特點，譬如野心、洞察力等等都和呂不韋非常相似，並且，秦始皇的母親也一直和呂不韋藕斷絲連。

但是也有人認為秦始皇就是皇室血統，畢竟最後殺呂不韋的就是秦始皇，可見兩人的關係一點也不親密。秦始皇的父親至今也未下定論，誰也沒有辦法肯定呂不韋和子楚哪個才是秦始皇的爹。