庫爾斯克戰役間歇期的另一場戰爭，發生在德軍後方。按照蘇聯方面的統計，截至1943年4月，德佔區游擊隊總人數已經增加到13萬人，主要編為1019個遊擊支隊，隸屬於193個遊擊兵團。游擊隊的戰鬥編成，通常為連、排、班。為了統一指揮這些游擊隊，蘇聯最高統帥部大本營此前設立了遊擊運動總司令部以及各地區遊擊運動司令部。透過無線電，這些司令部得以和80%的游擊隊保持經常聯絡，並不斷以空投等方式向游擊隊提供武器和指揮以及技術人員。

　　這些接受統一指揮的游擊隊，被視為蘇聯正規軍的輔助力量，其主要任務：諸如破壞德軍的後方交通運輸，偵查德軍的兵力和部署等等，都是以配合正規軍作戰為核心的。此外，蘇聯游擊隊也經常刺殺德國行政人員和職員，阻止德軍在佔領區掠奪人員和物資，甚至有時也會襲擊德軍小股守備隊，攻取一些中小城鎮。游擊隊的活躍程度，受到地域民族屬性的影響：在被佔領的俄羅斯和親俄的白俄羅斯地區（主要是中央集團軍群后方），游擊隊活動尤其頻繁；其他地區，尤其是西烏克蘭和波羅的海沿岸地區，則要遜色一些。在烏克蘭地區，甚至有反蘇和親蘇的兩種游擊隊存在。

　　為了對付蘇聯游擊隊，希特勒本人早在1942年8月18日就簽署了國防軍統帥部第46號訓令，要求在東方佔領區加強和游擊隊的鬥爭，“集中從國防軍各軍種、黨衛軍和警察中抽調的合適兵力，迅速嚴厲、主動的打擊游擊隊”。　　為了執行這個命令，德國人投入了相當龐大的力量。其中包括正規野戰軍的後方警衛警察部隊；正規軍後備部隊；各種內務警察部隊，和所謂的“當地部隊”，以及德佔蘇聯地區的所有其他德國人。

　　正規野戰軍後方警衛部隊，包括陸軍警衛師，大大小小的警衛和軍事警察憲兵分隊，以及匈牙利軍隊的幾個師。他們主要負責警戒陸軍後方的交通線、基地倉庫、指揮所等等。另外，德軍在後方的後勤和輔助人員，有時甚至還包括空軍機場人員，也經常被用於反游擊戰。德國陸軍總參謀長負責統一指揮正規軍戰區的反遊擊行動。截至1943年4月，陸軍作戰地區已經為反游擊戰投入了8萬人。　　野戰軍之外，根據希特勒的指示，從1942年10月開始，5個後備師（1943年7月前，東線實際部署了4個）和約5萬人的後備陸軍人員，也被送往德佔東部地區。這些後備部隊，一方面可以在必要的時候，為前線野戰軍提供補充。而在平時，則負責對付游擊隊。

　　黨衛軍以及警察頭子希姆萊所管轄的普通黨衛軍和德國警察，也向東線派出了強大力量。在里加、明斯克和基輔，德國人分別設定了“東部及俄國北部”、“俄國中部”、“俄國南部（後來改為烏克蘭）”黨衛軍和警察高階領袖，並以德國治安警察所屬的部隊為主幹。這些部隊不屬於軍隊序列，卻身著綠色軍事化制服，配備精良的武器，以團營為編制單位，甚至還擁有裝甲連。標準狀態下，1個警察團擁有3個營（每營約500人），有些還下屬3個炮兵連或1個裝甲連。儼然是一支戰鬥部隊，在反游擊戰中，警察部隊擔負主動進攻清剿的任務，但有時也會被投入前線野戰。根據筆者的初步統計，在東線有第2、6、8、9、10、11、13、14、16、28警察團，以及一些獨立武裝治安警察分隊。但其中第6、8、14警察團，已經在1943年1月被殲滅於東線南部。

　　除了武裝治安警察外，東線還有大量蓋世太保戰地秘密警察、黨衛軍保安處人員、刑事警察、輔助警察等等。這些警察主要隸屬於帝國保安總局。