雅克薩之戰清軍確實獲勝了，也可以說是“全勝”，但“大獲全勝”則不太妥當。俄軍的頑勇也給清軍留下很深印象。

第二次雅克薩之戰800俄軍對3000清軍，俄軍最後只剩60多人雙方才和談。這固然是清軍依靠火炮殲敵甚多，卻也可見俄軍的兇猛。其次，尼布楚條約並非不平等條約，而是平等條約，雙方大致劃定東部邊界。這裡面滿清做出了一些讓步，但並不等於有讓步就是不平等條約。

第三，康熙為何不乘勝追擊？乘勝追擊是完全不現實的。中俄交戰的外興安嶺，冰天雪地，清軍調動兵力非常困難。為了湊齊3000人的軍隊，康熙也是頭疼了好大一陣子。打仗不是玩遊戲，除了要兵，還要裝備，要後勤補給。乘勝追擊，繼續往西，吃的哪裡來，補給誰來運？相反，俄軍在雅克薩之戰前很長一段時間實際上採取類似游擊戰的方式在和清軍扯皮。他們的單兵作戰和小隊作戰能力是超過清軍的。所以，康熙如果要硬著頭皮乘勝追擊，估計會上演“追出幾百裡沒看到敵人，一撤退敵人就又來了”的鬧劇。而進一步的壓迫，則可能因為交通線太長而遭到敵軍反擊敗北。

第四，康熙簽署這個條約，還和當時國內局勢有關。當時西部準噶爾汗噶爾丹在沙俄支援下於西北叛亂，蒙古震盪，這才是清政府的心腹之患。康熙要把主要精力放在西北，為了避免兩線作戰，做出適當讓步也是迫不得已。

最後，這也和兩國定位有關。雖然從地理角度來說，雅克薩地區距離俄羅斯首都莫斯科比清朝首都北京要遠得多，俄軍屬於客場作戰。但從兩國本身的性質來說，滿清延續了中華帝國的作風，最邊境這些窮山惡水的地方並不那麼看重。而沙俄正處在積極擴張的上升期，遠東對他們是志在必得。這也造成了雙方談判的底線不同，於是在我們看來，康熙放棄了一些土地，似乎顯得有點可惜。

這也就成為清政府的第一個和外國侵略者簽訂的不平等條約。