哈薩克汗國並非在準噶爾的統治之下，清朝在滅掉準噶爾之後，立即就引起了哈薩克汗國的警覺，而眼瞅著中亞諸國已經有抱團之勢，清廷決定結束戰爭，保住自己剛剛佔領的地區

提及哈薩克汗國的歷史，就不能不提準噶爾，它倆是一輩子的仇敵。

準噶爾原本是厄魯特蒙古的一個部落，厄魯特是清代對漠西蒙古的稱呼，明朝時候管他們叫瓦剌，而他們自稱是衛拉特。

厄魯特蒙古，也就是漠西蒙古，他們與東部蒙古在血緣上並不是那麼緊密，雖然大家都是蒙古人，但東蒙古一直是看不起西蒙古的。

蒙古民族是由成吉思汗開創的，“蒙古”的名字就是來源於東蒙古地區斡難河上游的蒙古部，後來成吉思汗統一了整個蒙古高原，將整個高原上的各個部落整合為蒙古族。而位於西蒙古地區的這些蒙古人，其文化和血緣與東蒙古地區相差較大，以至於東蒙古壓根不把西蒙古當做是蒙古人。在1640年編寫的《喀爾喀—衛拉特法典》中明確表示，衛拉特蒙古（西蒙古）不算是蒙古。

1388年北元后主脫古斯帖木兒被阿里不哥後裔也速迭爾殺害後，大元國號停止使用，蒙古也很快分裂成為東部的韃靼（東部蒙古，也叫中央蒙古，由黃金家族擔任大汗）和西部的瓦剌（西部蒙古），雙方之間互相打仗。

到了明末，東西蒙古都處於分裂狀態，後金（清朝）興起之後，利用東蒙古各部之間的矛盾，遠交近攻，吞併了東蒙古南部地區，滅掉了蒙古大汗直接統轄的察哈爾部，建立了漠南蒙古，開啟了吞併蒙古的征途。

察哈爾部的滅亡震驚了整個蒙古高原，東部蒙古地區只剩下了漠北蒙古。而面對強大的清朝，漠北蒙古選擇向清朝稱臣，而為了牽制漠北蒙古，漠西蒙古（西蒙古）的盟主，和碩特部首領固始汗也派人前往盛京，向清朝稱臣。

在明末清初時漠西蒙古分成五大部落：和碩特部、準噶爾部、杜爾伯特部、土爾扈特部、輝特部。後來由於土爾扈特部西遷，於是只剩下了四個。在清初時，和碩特部是漠西蒙古的老大。

1676年，準噶爾部臺吉噶爾丹打敗和碩特部盟主鄂齊爾圖汗，把鬆散的部落聯盟逐漸轉變為強有力的中央集權制汗國，建立了準噶爾汗國，噶爾丹自稱大汗。

準噶爾汗國崛起之後就開始四處擴張，噶爾丹先是滅掉了位於新疆的葉爾羌汗國，將天山南北盡收入囊中，然後又向西與哈薩克汗國開戰。

其實早在準噶爾統一漠西蒙古之前，準噶爾部就常年與哈薩克部交戰。哈薩克汗國建立於1456年，是成吉思汗後裔賈尼別克汗（朮赤系）所創立的了。

在準噶爾尚未統一漠西蒙古之前，準噶爾和哈薩克的交戰各有勝負，而在噶爾丹建立準噶爾汗國之後，哈薩克就只有捱揍的分了，噶爾丹將哈薩克人打得吐血。

不過哈薩克並非噶爾丹的第一目標，噶爾丹的願望是統一整個蒙古高原，之後南下北京，重現當年蒙古帝國盛世。1688年，噶爾丹率兵越過杭愛山進攻漠北蒙古（東蒙古），這一舉動成功地保住了哈薩克汗國。

上文解釋道，在清初的那個時代，漠北蒙古根本不把漠西蒙古看做是同胞，對於噶爾丹的來襲，漠北蒙古就視之為異族入侵。由於不敵噶爾丹，後經活佛哲布尊丹巴呼圖克圖倡議，漠西蒙古全部投降清朝，清軍清軍保護，康熙皇帝決定北上抵禦噶爾丹。

正當噶爾丹欲傾兵南下時，他的侄子策妄阿拉布坦發動政變，端了噶爾丹老巢，導致噶爾丹失去後援。但此時的噶爾丹沒有選擇回國與策妄阿拉布坦爭權，而是選擇孤注一擲，南下進攻中原。

1690年，噶爾丹引兵三萬在烏珠穆沁擊敗清軍先鋒部隊，隨後直接殺到了內蒙地區，清廷大驚，康熙皇帝宣佈北京戒嚴，並立即調集八旗和內蒙蒙古騎兵共10萬前往迎戰，雙方在內蒙古烏蘭布通展開大戰。

此戰康熙原本是御駕親征，但在到達烏蘭布通之前，在大臣的“勸說”下，最後還是抱病留守，由和碩裕親王福全領兵前往。

刨去輜重部隊，清兵投入到前線的兵力大約在8萬人左右，在兵力上對準噶爾有絕對優勢，並且清軍的大炮和火槍數量都遠多與準軍，因此清軍在戰術上多多路進軍，意圖全殲準軍。

但是在之前的烏珠穆沁之戰中已經暴露出清軍戰鬥力不低準軍，雙方打肉搏戰清軍不佔優勢。而面對清軍的來襲，準軍祭出了“駝城”部署，這一戰術應該是脫胎於歐洲的“胡斯車堡”，在15世紀是一種非常有效地陣地戰術。

由於在準軍的駝城正面是沼澤，清軍大炮的射程夠不到，於是福全決定迂迴攻擊，但卻被準軍反殺，以至於一等公佟國綱都戰死了。

無奈之下，福全只得依靠兵力優勢與準軍開炮對射，最後由於彈藥告罄，準軍以議和為由騙過了福全，從容撤退。

準軍北撤之後曾向清廷求和，畢竟老家都沒了，噶爾丹一時很難重建根據地，無法獲得大量兵力補給。但噶爾丹並沒有投降之意，而清廷也加緊對漠北蒙古的控制，雙方都在準備著新一輪戰事。

1696年，清軍在昭莫多（烏蘭巴托南部）與準軍再戰，清軍以絕對優勢兵力重創準軍，噶爾丹敗逃自殺，其骨灰被他侄子策妄阿拉布坦獲得，最後在清朝的威逼下，策妄阿拉布坦將噶爾丹骨灰交給了清朝。

噶爾丹死後，策妄阿拉布坦統領準噶爾汗國，這個人非常厲害，在他的統治下準噶爾進入全盛時期，準軍在外蒙多次擊敗清軍，1731年清軍於博克託嶺、和通泊之戰慘敗給準噶爾，迫使清廷與準噶爾言和。

在於清廷言和之後，準噶爾汗國逐漸騰出手來對付北邊的沙俄和西邊的哈薩克。

由於在頭克汗之後，哈薩克汗國分裂成了大、中、小三個玉茲，實力有所衰弱。而面對著強大的準噶爾，哈薩克汗國又是被欺負地抬不起頭來，特別是與準噶爾接壤的大玉茲，更是直接能臣服於準噶爾。

但好在沙俄不願意看到準噶爾稱霸中亞，總是在背後支援哈薩克，讓哈薩克汗國免於亡國。

1745年，準噶爾第三代大汗噶爾丹策零（策妄阿拉布坦長子）染瘟疫暴斃，準噶爾陷入嚴重的內鬥，哈薩克汗國中的中玉茲大汗阿布賚趁機東進，收復了許多失地。

但令哈薩克人萬萬想不到的是，在捕獲準噶爾內亂的訊息後，當時在位的乾隆皇帝頂著所有所有人的壓力，直接發兵五萬攻打準噶爾。

1755年，清軍在輝特部臺吉阿睦爾撒納的引導下一舉滅掉了準噶爾汗國！此訊息立即震驚了整個哈薩克汗國，哈薩克大汗阿布賚迅速在中哈邊境部署兵力，嚴陣以待，堤防清軍來襲。此外哈薩克還大量收留從準噶爾逃民，並積極與沙俄聯絡，共同抗擊清帝國。

在拿下準噶爾之後，清軍在中哈邊境與哈薩克發生多次小規模衝突，雙方均有勝負。由於南當時南疆地區又發生了大小和卓叛亂，清軍主力盡數南調，無力在向西與哈薩克開戰。在覺察到中亞的幾個汗國已經抱團的情況下，清挺決定熄戰，保住新戰略的土地，於是最後中哈雙方達成議和，劃分邊界，而哈薩克汗國則向清朝稱臣。