中國清朝初期蒙古準噶爾部在新疆崛起。1688年，康熙二十七年，噶爾丹親率3萬騎兵自伊犁東進，越過杭愛山，進攻喀爾喀蒙古（外蒙），佔領整個喀爾喀地區。喀爾喀三部首領率眾數十萬分路南逃，並向康熙帝求援。於是，清朝和準噶爾部在1690年正式開戰。

而當時的準噶爾汗國，屬於上升期，勢力非常大，控制了將近四百多萬平方公里的領土。並且準噶爾士兵的素質也是異常彪悍！而且準噶爾還得到了沙俄的武裝支援，在武器裝備方面比清軍要先進。

但是康熙皇帝力排眾議，頂著壓力，集結了十萬人馬，進攻準噶爾，戰爭一直持續，直到乾隆二十年之後，準噶爾內部為了爭奪大汗之位，爆發了內訌。乾隆皇帝乘此機會，以五萬大軍直攻伊犁，滅掉了準噶爾，並且控制了北疆，耗時了70年。

而到左宗棠時代，雖然也是內憂外患，新疆暴亂，但是此時的浩罕國佔據的只是新疆大部，對西藏和漠北蒙古地區並沒有涉及，也沒有康熙時期的準噶爾國大，因此左宗棠的作戰跨度小，自然難度就低，而且，戰線縮短，左宗棠可以集中兵力！

再加上左宗棠1876年收復新疆時，西征軍已經全部裝備了最新的西式裝備，新型後膛炮和加特林機槍，而阿古柏遠不如清軍武器先進，打阿古柏自然不在話下，一年半肅清新疆除伊犁外的所有地區，兵臨伊犁城下，收復新疆！