曹操在建安四年（公元199年）年初，又以漢獻帝之名命令自己、孫策、衛將軍董承、益州牧劉璋等人一起討伐袁術、劉表，孫策接到詔書後，即整頓軍隊準備對袁術發起進攻。孫策的軍隊還沒有出發，袁術就病死了，孫策就勢率軍西進討伐殺父仇人、駐紮在夏口（今湖北省武漢市）的黃祖。

孫策的軍隊行至石城（今安徽省池州市貴池區西）時，聽說了劉勳傾巢出動、進攻上繚的消息，他當即命令堂兄孫賁、孫輔二人率領八千軍隊繼續推進到彭澤（今江西省湖口縣），切斷劉勳的退路，他自己則與周瑜二人率領兩萬軍隊棄舟登岸，奔襲皖城。孫策很快就攻克了皖城，俘獲袁術、劉勳的家眷以及袁術舊部三萬餘人。而後，孫策任命李術為廬江太守，留下三千軍隊駐守皖城，把俘虜全部押回了江東。

劉勳回到彭澤，又被孫賁、孫輔擊敗，遂從潯陽（今江西省九江市）徒步來到置馬亭（在今九江市境內）。聽說孫策已經攻克了皖城，劉勳只得率軍西逃，來到西塞。不久，劉勳又來到流沂（今湖北省鄂州市），在那裡構築防禦工事，並向劉表、黃祖求救。黃祖派遣其子黃射率領五千水軍前來增援，孫策率軍乘勝追擊，再次大破劉勳，劉勳與劉偕逃到許都，投降了曹操，黃射也退去了。孫策繳獲了劉勳一千多艘戰艦，俘虜了劉勳兩千多人馬，而後，繼續西進向夏口（今湖北省武漢市）的黃祖發起了進攻。劉表派侄兒劉虎、部將韓晞率領五千長矛軍前來助戰。

十二月八日，孫策兵臨沙羨（在今湖北省嘉魚縣北長江中，從晉武帝以後遷至今湖北省武漢市武昌區南）。十一日凌晨，孫策率領周瑜、呂範、程普、孫權、韓當、黃蓋等將向黃祖、劉表聯軍發起了猛烈的攻擊，很快就大破黃祖軍，陣斬劉虎、韓晞等兩萬多人，俘獲黃祖妻子兒女，繳獲六千多艘戰艦，各類財物堆積如山，黃祖軍被水淹死的又有上萬人，唯獨黃祖脫逃。

孫策發兵進攻夏口的黃祖，是因為∶

一、有許都朝廷的命令。此時各個軍閥都是深諳縱橫捭闔、遠交近攻之術，劉表、張繡與曹操為敵，且與袁紹勾勾搭搭，曹操出於牽制劉表的目的，鼓動孫策進攻袁術、劉表，是題中應有之義。

二、黃祖與孫策有殺父之仇。七年前，孫策之父孫堅被黃祖射殺，此仇一直未報，如今，孫策手裡握有漢獻帝的詔命，前去討伐黃祖是名正言順之事。

三、迷惑劉勳。孫策以討伐黃祖之名，整頓軍隊西上，不會引起劉勳的警覺。在孫策大軍西上時，劉勳果然沒有介意，反而以為孫賁、孫輔之軍是在幫助自己，結果，讓孫策先端掉了老巢。

四、華歆無所作為。太史慈給孫策帶來了豫章的絕密情報，孫策由此斷定豫章太守華歆根本無所作為，這也是孫策敢於長途奔襲夏口的另外一個原因。

擊敗黃祖後，孫策並沒有繼續北上，而是回師東進了，其間的原因也非常簡單∶有人也想端掉他孫策的老巢。

此人便是伏波將軍陳登。陳登在廣陵郡很有威名，史稱，他"忠亮高爽，沈（沉）深有大略，少有扶世濟民之志。博覽載籍，雅有文藝，舊典文章，莫不貫綜”，在東漢末年也是一位風雲人物。

據《先賢行狀》及《三國志·孫策傳》注引《江表傳》稱，陳登將廣陵的治所遷至射陽（今江蘇淮安市東南）。陳登在廣陵期間，賞罰嚴明，深得當地百姓的喜愛，海盜薛州擁有一萬多戶部眾，也歸降了陳登；陳登還興修水利，百姓們稱之為陳登塘。陳登在江淮之間深得人心，遂產生了吞併江東孫策的野心。

如前所述，陳登是陳瑀的侄兒，孫策將陳瑀滅掉，陳登一直伺機想替叔父報仇雪恨。當他看到孫策傾巢出動，長途奔襲黃祖後，也效法陳瑀、袁術的故技，暗中派人潛入江東，給嚴白虎的餘黨封官許願，企圖將江東搞亂。

孫策當然想一舉滅掉劉表、黃祖，但他對陳登的心思也是洞若觀火，對其不得不防。況且，孫策在江東的地位尚不十分穩固，尤其是他在平定江東過程中，誅殺了大量江東大族以及對自己不恭的名士們。

孫策清除江東大族固然有他不得已的苦衷，但勢必帶來巨大的負面影響，這些長期盤踞在江東的大族豪強們雖然受到很大的打擊，可是，他們潛在的影響力仍然不容小覷，一旦有個風吹草動，勢必風雲再起。另外，在涇縣以西的豫章郡還有一個華歆需要解決。華歆雖然不是一位英雄人物，但在他的周圍不乏蠢蠢欲動的宗部頭領，時間一長，如果再出現一位英雄人物，將會直接威脅到江東腹地，因此，孫策只有趁機全取了江南，才有餘力與群雄爭奪中原。

當孫策揮師東進時，遂打算順便解決了華歆，於是，他率軍進入豫章郡，駐紮在椒丘（今江西省新建縣北）。虞翻曾任王朗的功曹，而王朗與華歆是老友，因此，孫策想不戰而屈人之兵，讓虞翻前去勸降，他對虞翻說∶“華子魚當然是位大名鼎鼎的人物，卻不是我的對手。如果不開城投降，戰鼓一鳴，不能不會出現傷害，你替我走一趟，替我傳達我的意思。”

虞翻來見華歆，對他說∶“我聽說大人與我們郡的前任太守王朗齊名，聞名四海，雖然我偏居東南一隅，對您卻非常敬仰。”

華歆謙虛地說∶"我不如王會稽。"

虞翻又說∶ “我不知豫章郡的糧草、兵器以及居民的戰鬥力，與我們郡相比如何”

華歆回答∶“差遠了。”

虞翻又說∶ “大人稱不如王會稽，那是謙虛之詞；精兵不如會稽郡，那倒是真的。孫討逆智略超過當世，用兵如神，過去，曾趕跑了劉揚州（指劉繇），這是大人親眼所見的；而後又南定我們郡，想必大人也聽說過。如今，大人打算困守孤城，糧草不足，如果不早早決斷，後悔就來不及了。如今，孫將軍的大軍已經近在椒丘，在下也將回去，如果大人到明天中午仍然定不下迎接孫將軍的決定，在下就告辭了。”

華歆說∶“我在江南時間也長了，經常想北返中原，孫會稽前腳來，我後腳就離開這裡。”

華歆連夜命人撰寫迎降檄文，第二天一大早，就派人來到孫策軍中奉迎。孫策遂率軍進抵豫章（今江西省南昌市）城下，華歆身穿便裝出城相迎。孫策對華歆說∶ "府君德高望重，名滿天下，為遠近人心所歸。孫策我年少幼稚，應該以子弟之禮見您!”遂向華歆下拜，奉為上賓。

孫策在短短的數月之間，就佔皖城，破劉勳，敗黃祖，下豫章，以一旅之眾輕鬆挫敗了三方勢力，不費吹灰之力就將自己的勢力範圍向北拓展到了長江以北，向西延展到了豫章。他不僅用兵如神，更重要的是還具備那種超群的戰略眼光和對世事人心敏銳的洞察力∶打劉勳，靠的迷惑和偷襲；敗黃祖，靠的是果敢和頑強；降華歆，靠的是自信和智謀。曹操聽說孫策平定了江南，感到非常頭疼，他經常把孫策掛在嘴邊，嘆息著說道∶“這個小瘋狗實在是難以對付啊!”

得到豫章郡以後，孫策將豫章郡一分為二，又成立了一個廬陵郡（今江西省吉安市），任命孫賁為豫章太守，孫輔為廬陵太守。恰巧，割據廬陵的變民頭領僮芝病死了，孫輔遂進駐廬陵。孫策又命周瑜鎮守巴丘（今江西省峽江縣北），負責接應豫章、廬陵兩地，又能監視他這兩個堂弟（孫賁、孫輔二人是親兄弟）。

孫策在佔領皖城、豫章後，一改大肆殺戮大族的做法，對袁術一家非常照顧，後來，袁術的女兒嫁給了孫策的二弟孫權，袁術的兒子袁曜被拜為郎中，袁曜的女兒又嫁給了孫權的兒子孫奮；攻克豫章後，孫策收斂劉繇的棺材，善待他的家眷，這一系列舉措都讓孫策贏得了士大夫們的好評，也使孫策開始穩固江東的統治。