新風系統能夠源源不斷為室內輸送空氣、將室內汙濁的空氣排出室外，為室內空氣的含氧量、潔淨度創造了條件，尤其是在不用開啟門窗的條件下實現室內換氣。然而，在實現室內通風換氣的同時，使用新風系統常遇到的問題有：需要在牆上或窗戶開洞才能實現室內外換氣，而牆體或窗戶在室外有大風吹得時候會產生異響，時而會影響到室內的日常作息；新風系統使用時間久了，有的電機和氣孔在新風系統執行時也會產生噪音。

當新風系統的電機在高速運轉時所產生的噪音較容易理解，抽風、排風等都需要電機帶動，產生噪音在所難免。此外，高風速的氣流經過新風系統的進出風口時，也會產生噪音，這部分噪音的大小與進、排風管道口徑的大小緊密相關，口徑太小風速太快，氣流聲也較大，反之氣流聲相對較小。因此，在安裝新風系統時，要特別注意根據室內空間大小、位置等選擇合適的新風系統，尤其是新風管道的長短、大小等進行合理設計。

對於大部分雙向流新風系統，安裝基本上都需要開孔，室外的噪音會隨孔而入，特別是部分使用者不想在牆上開孔的，選擇窗戶的玻璃為進出風口，相較於牆體，玻璃的隔音效果更差，因此，當視為風速較大時，窗戶開孔後收到噪音的干擾更加嚴重。當然，鑿牆開孔安裝新風管道，在室外氣流較大時也同樣會干擾室內。因此，在安裝新風系統的進、出風口時就需要使用者特別注意此問題，以減少噪音的干擾。

因此，在選擇新風系統、安裝新風系統時，需要結合自身所處的環境等綜合因素，按需選購，而不是盲目跟風。既要考慮新風系統的換氣速率、淨化效果，同時也要考慮到噪音的影響等等。