蘋果樹黃鏽應與蘋果樹果鏽區相同分開水果鏽病主要由病蟲害引起，主要影響果實，而黃鏽病主要影響樹幹、根系、枝葉，甚至導致樹木死亡，因此危害較大。蘋果樹黃鏽病的防治措施如下。

由於蘋果鏽病病原菌具有跨主寄生、循環中無再感染的特點，必須在跨主寄主上才能完成病害循環，因此必須儘可能消除或減少跨主寄主。如果蘋果園周圍沒有主寄主，就不會發生鏽病。因此，在蘋果主產區，政府可以出具文件，在蘋果園5公里範圍內不得種植柏樹、柏樹、柏樹等黃鏽寄主。

如果在蘋果樹萌發至幼果期的幼葉、嫩枝或幼果上發現蘋果鏽斑，應立即噴1 ~ 2次唑類殺菌劑，防止病原菌擴散，或在大範圍降水前噴一次殺菌劑，防止降雨過程中鏽菌侵染。

有效劑型有：15%三唑酮2000倍液可溼性粉劑、10%二苯環唑水分散顆粒2500倍液、43%戊唑水乳液或懸浮液4000倍液、25%丙環唑乳液2500倍液、12.5%硝基唑水乳液2000倍液。

其中比較安全的是10%苯並二甲環唑水分散顆粒2500倍液。噴施2天后，病斑不再擴大，邊緣顏色變淡，逐漸變為黃綠色。15 d後，病斑在額葉形成厚而硬的黃褐色結節，邊緣呈黃綠色，最後突變為黑褐色。

蘋果鏽病是一種對柏樹枝條有害的病害，可在癭中越冬。褐色的冬季孢子角形成於第二年的春天。冬季孢子的柄是凝膠狀的，由降雨或極度潮溼的空氣引起的胺化作用而膨脹。冬季孢子萌發產生大量的擔孢子，通過風傳播到蘋果樹。

鏽菌侵染當年蘋果樹的葉片、葉柄、果實和枝條，形成有性孢子和有性孢子、鐵鏽孢子和鐵鏽孢子。鏽斑孢子成熟後擴散到杜松體內，侵入杜松枝條，菌絲體在杜松生長部位越冬。

在蘋果主產區，可由政府部門出具相關文件，禁止在蘋果園、梨園、山楂園周邊10公里範圍內種植柏樹，禁止設置松柏樹苗苗圃。道路兩旁、公園、墓地、庭院等場所可採用非柏科樹種綠化樹木。

這是防治蘋果鏽病的根本措施。2. 對於蘋果主產區，蘋果園周圍有針葉樹，會造成嚴重破壞，當地政府可以協調將蘋果園周圍5公里內的針葉樹更換為其他綠色樹種。噴施保護蘋果鏽病主要發生在蘋果萌發後60天內，即4月至5日，6月中旬後鏽菌不再感染。

對每年周圍有柏樹、病蟲害嚴重的蘋果園，從蘋果葉期開始每10-15天噴1次殺菌劑，噴2-3次甚至可防止鏽菌侵染；或在有大範圍降水或天氣預報前噴灑殺菌劑，防止鏽菌在降雨過程中感染。

在鏽菌侵染蘋果葉片後5 d內噴施內殺菌劑，可有效控制入侵細菌的傳播和病害，噴施時間越晚，防治效果越差。噴藥治療應嚴格控制用藥時間。用藥時間可按以下方法確定：

4、5月降雨量超過5mm，持續時間超過12小時，應在降雨後5天內噴灑內部殺菌劑。或在冬季孢子角萌發大量，即“柏樹開花”，並在“柏樹開花”的同時有持續降雨12小時以上，在“柏樹開花”後5天內噴灑內部殺菌劑。

或是在蘋果、梨葉開始發病時，即出現大小紅斑，立即噴內 內部使用的殺菌劑有氟硅唑、二苯醚、三唑；常用的保護劑主要是代森錳鋅的有效成分。