雖然納卡衝突已經停戰多日，亞塞拜然和亞美尼亞也基本落實了交割領土的事宜，但是這並不意味著納卡從此就迎來和平。作為勝利者一方的亞塞拜然，在納卡犯下了大量戰爭罪行，會對納卡局勢造成什麼樣的影響？亞塞拜然是否會和亞美尼亞再次爆發衝突？

據亞美尼亞媒體12月9日報道稱，亞塞拜然軍隊在佔領納卡之後開始大規模清算，對當地的亞美尼亞平民以及涉嫌“通敵”的亞塞拜然人展開報復，甚至出現了屠殺平民的暴行。亞美尼亞方面認為，這是非常嚴重的戰爭罪行，呼籲國際社會派出調查團就此事進行調查，但是截至目前，國際社會對此尚未給出明確的迴應。

根據阿軍士兵釋出到網上的最新影片顯示，一名亞美尼亞老人被一群阿軍士兵抓住，然後被按在地上割喉斬首。在這期間，這名老人對亞塞拜然士兵哭喊救命，但是卻換來了現場阿軍的一通嘲笑，最終還是未逃脫被殘殺的命運。俄羅斯媒體認為，上述對亞美尼亞平民的暴行簡直是滅絕人性，呼籲亞塞拜然方面給予調查，並確保今後不再出現類似的事件。但是亞塞拜然軍方則認為，這並非該國士兵所為，是亞美尼亞方面的“輿論戰”。

據悉，這也是阿軍方的固定說法，之前在面對類似指控時，阿軍都是以此為口徑迴應。據報道，雖然阿軍方多次嚴令禁止將戰場照片和影片外傳，並堅稱將保護納卡地區的亞美尼亞平民，但是從納卡衝突爆發至今，還是有大量的戰爭暴行影片被阿軍士兵流出。外界認為，亞塞拜然軍隊的戰爭犯罪目前曝光的很可能，只不過是冰山一角，但是作為勝利的一方，阿軍的犯罪行為也無法被追究責任。

無論是美國還是其他周邊國家，都對此睜一隻眼閉一隻眼，而處於受害者一方的亞美尼亞，更是忙於內鬥無暇顧他，這使得很多犯下罪行的阿軍士兵逍遙法外。亞美尼亞方面表示，亞塞拜然軍隊正在有組織的對納卡地區實施種族清洗行動，大量針對亞美尼亞人的酷刑和非人待遇都證明了這一論斷。

亞塞拜然打算對納卡的當地平民實施種族滅絕政策，犯下罪行的阿軍士兵非但不會遭到追責，反而會得到亞塞拜然方面的讚揚和鼓勵。據報道，在戰爭結束後，亞塞拜然也開始論功行賞，將大量亞美尼亞平民撤離之後留下的房屋，分配給參戰的阿軍士兵，或是在三十年前從納卡逃離的難民，這也進一步加劇了亞美尼亞和亞塞拜然之間的仇恨。