西奧博爾德將軍和其他許多軍官—樣，曾經懷疑美軍情報部門所提供的情報也許是中了日軍的奸計。日軍是不是佯攻阿留申群島的西部島嶼，企圖把美軍從比較重要的荷蘭港及科爾德灣誘開？西奧博爾德對此甚為擔心。因此，他決定集中兵力保衛上述要地。西奧博爾德的水面艦艇部隊幾乎從來不到岸基飛機和水上飛機的活動半徑外去作戰。美軍最西面的基地設在烏姆納克島的沃特角。這樣，美軍的特混部隊就絕無機會與日本艦隊交戰了。

　　西奧博爾德將軍命令主力部隊(巡洋艦5艘、驅逐艦4艘)在科迪亞克島以南400海里處會合。最後一批軍艦直到日本艦隊襲擊荷蘭港數小時後，即6月3日上午才到達會合點。他把一支驅逐艦部隊(9艘)留在烏納拉斯卡島的馬庫欣灣，以便擊退日軍在荷蘭港一帶的登陸。可是，只有在戰機有利時，才能使用這支部隊。所以，防禦的主要任務就由航空兵來承擔了。但是，飛機太少，海軍僅有進行偵察的20架PBY型水上飛機。陸軍約有65架戰鬥機，但其中有40架左右根據陸軍的需要配置在科爾德灣和烏姆納克島。航空兵的主要突擊兵力是20架B-26型陸軍轟炸機，分別配置在科迪亞克島、科爾德灣及烏姆納克島。

　　為能早期發現來犯的日本艦隊，並及時出警報，西奧博爾德將6艘潛艇配置在敵人最可能來襲的海域，將20艘巡邏艇配置在荷蘭港以南和白令海方向約200海里的海域。各接近處均有PBY水上飛機進行巡邏，但缺少裝備雷達的水上飛機巡邏的最大距離只有400海里。

　　儘管如此，從西南偏南方向來襲的角田部隊(2艘航空母艦)，還是未被美軍的潛艇、巡邏艇和飛機發現。6月3日1時剛過，高緯度的阿拉斯加地區已是拂曉，角田將軍在荷蘭港的南約165海里處，令36架艦載機起飛。當時天氣不好，使角田海軍少將得以避開美軍隊巡邏。但是，這對美軍也有好處，如“隼鷹”號的艦載機因晨霧瀰漫而偏離航向，沒有發現目標就返回了航空母艦。可是，“龍驤”號的突擊機群穿過雲隙，空襲了荷蘭港。這次空襲來得十分突然，給美方造成極大損失，而日軍僅損失2架飛機。

　　日突擊機群在返航途中，發現停泊在馬庫欣灣的5艘美國驅逐艦。角田立即命令另一突擊機群起飛，但因天氣越來越壞，飛機無法編隊飛行。美軍從沃特角基地起飛應戰的P-40型飛機，擊落日機2架。日軍飛機未能飛抵馬庫欣灣。

　　日軍襲擊荷蘭港後，美軍的巡邏機幾乎全部出動去搜索日本航空母艦編隊，但是沒有發現目標。其原因之一是美軍以為日軍的襲擊來自白令海方向。另一個原因是角田部隊襲擊馬庫欣灣的企圖落空後，已向西南方向撤離。爾後，角田準備前去襲擊阿達克島，但因該地天氣不良，不得不放棄這一企圖，轉而對荷蘭港實施第二次襲擊。

　　6月4日4時50分，當一架PBY型水上飛機向西奧博爾德報告角田部隊的位置時，角田已令艦載機飛向荷蘭港。此後，美機與日軍的戰鬥接觸斷斷續續，美軍以少量飛機多次襲擊日軍。但是，不論裝有魚雷的PBY型飛機，還是B-26型、B-17型飛機，均不適於用來襲擊艦艇。雖然飛行員們極其勇敢，但是除有幾顆近失彈外，均未擊中目標。美機損失3架，三種型號的飛機各損失1架。

　　16時許，在美軍再次發起攻擊之前，角田派出的突擊機群已經飛臨荷蘭港上空。日突擊機群經過30分鐘的轟炸，使美軍儲存22000桶汽油的新油罐起火，“西北”號舊式救生船被炸傷擱淺，一個飛機庫和一個倉庫被炸燬。後來，“隼鷹”號上的艦載機在烏納拉斯卡島西部上空會合肘，又發現了沃特角的陸軍隱蔽機場。但這時美戰鬥機已升空，日機被擊落4架。

　　這時已有跡象表明，日軍在中途島附近的作戰，還不如阿留申群島方面進展得順利。角田剛令其突擊機群離艦，就接到山本的命令，要他速與機動編隊會合。幾乎與此同時，山本又通知他，中途島作戰和對阿留申群島作戰延期實施。角田部隊用了兩個多小時將飛機收回後，轉向南下，前去與南雲部隊會合。但是，山本在幕僚們的再三建議下，這時又改變了決心，同意阿留申登陸部隊按原定計劃執行。然而，北方部隊指揮官細萱海軍中將將作戰計劃作了一些改動，決定不在阿達克島登陸。因為新發現的沃特角美軍機場離阿達克島僅有350海里。所以他認為在阿達克島登陸太冒險了。

　　6月6日中午剛過，日海軍特別登陸隊約1250人登上了基斯卡島，俘虜了美國一個小氣象站的工作人員。翌日拂曉，日陸軍部隊約1200人在阿圖島登陸，拘留了39名阿留申人和一名美國傳教徒及其妻子。直到6月10日，美軍巡邏機才發現這兩個島上的日軍。