第十六屆國際基因組學大會(ICG-16)於10月25-31日在山東青島隆重舉辦。在今年ICG大會上,華大智造聚焦“組學領域的創新思路與工具”,對其核心業務基因測序儀進行了全面的效能升級。
DNBSEQ-T7:正式推出高通量測序試
劑套裝V2.0,資料產出更高、更穩定
基於日通量超高的測序儀DNBSEQ-T7,華大智造對其測序試劑進行了重要升級,正式推出高通量測序試劑套裝V2.0,在生化反應和演算法等方面進行了最佳化,錯誤率和重複率進一步降低,資料有效利用率更高,資料產出更穩定,變異檢測精確度和靈敏度提升,旨在提供產量更高、質量更好的資料產出。
華大智造對來自3家客戶121個Run的下機資料進行了統計,結果顯示:在不同實驗室、不同樣本型別以及不同程度的複雜文庫的情況下,採用高通量測序試劑套裝V2.0,DNBSEQ-T7均能保有高穩定性和高質量資料的產出。該試劑盒現已全面投產,即日起即可訂購。
MGISEQ-2000:正式推出長讀長測序
試劑盒(FCS,PE300),Q30>80%
在中高通量測序儀MGISEQ-2000上,華大智造推出了基於DNBSEQ平臺的首個PE300長讀長測序試劑盒。該產品採用了最新的DNA奈米球生成和載入技術——MLG技術(Make DNB、Load DNB and Grow),能夠實現對於DNA奈米球更加精準的控制,增加複製數並增強訊號,支援更長讀長測序和更高質量的資料產出。
在組學研究領域,對於需要進行基因組拼接的應用,往往希望讀長越長越好,但讀長越長測序質量越難把控。此次華大智造創新性地採用了一種全新的滾環擴增和載入DNB(DNA Nano Ball,DNA奈米球)的方式——MLG(Make DNB、Load DNB and Grow)。不同於以往DNB製備後直接載入到載片上進行測序的方式,MLG會先進行少量的滾環擴增,形成較小的DNB(即Make DNB),並在其載入到載片上後繼續對其進行滾環擴增(Load DNB and Grow)。這一點有效確保了長讀長的DNB訊號可以更強。除此之外,華大智造在此基礎上,對該試劑盒的試劑組分進行了最佳化和升級,並採用指數孵育等措施,促進生化反應更充分,提高了反應效率。目前,來自早期客戶236個文庫的下機資料顯示,基於MGISEQ-2000的長讀長測序試劑盒(FCS,PE300),資料產出高達180-360Gb,Q30>80%,檢出結果平臺間高度一致。
PE300讀長尤其適用於微生物16S/18S/ITS測序,特別是對於16S rRNA中的V3+V4區域,PE300讀長不僅可以完整覆蓋V3+V4區域460bp的基因序列及建庫過程中融合的引物序列,還能透過雙端測序重疊的部分來進行更好的拼接。基於MGISEQ-2000平臺的PE300讀長上市,為廣大16S/18S/ITS測序使用者,以及相關的微生物功能基因研究提供了通量更大、資料質量更優的選擇。
另外,為了更好地適配多樣本靶向測序,華大智造正式開放ATOPlex多重PCR定製化平臺,以幫助使用者個性化開發基於多重PCR技術的靶向測序建庫試劑盒,在微生物、農業等領域上都可以支援多樣本資料產出。
MGISEQ-200:正式推出BBS測序
功能,與中疾控傳染病所展開科研攻關
在小通量的測序儀MGISEQ-200上,華大智造與中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所聯合開展科研攻關,針對一線使用者在傳染病防控中對快速測序和精準測序的雙重需求,推出了多時點測序資料輸出及序列分析(簡稱BBS技術)。該技術能夠在測序過程中實現多時點抽取資料進行分析,同時提前啟動序列分析,既能夠快速識別又能夠精準溯源。
目前,該項技術已在雙方橫向課題專案中開展第一階段的測試和驗證,結果表明:這一技術分時點進行測序資料輸出及分析,可在公共衛生防控中更及時響應病原微生物快速鑑定及精準溯源。該技術將率先在MGISEQ-200上應用,並將作為創新技術支援我國公共衛生體系中的病原微生物基因組學分析。
結 語
在生命科學的藍海領域,核心工具始終是產業研究和應用的重要基礎和武器庫。依託“DNBSEQ測序技術”、“規則陣列晶片技術”、“測序儀光機電系統技術”等為代表的多項源頭性核心技術,華大智造在業內始終堅持創新,保持引領,賦能生命科生命科學產業發展。
多年來,華大智造不斷推陳出新,不僅開發了多款中小型桌面型測序儀、以及大型和超大型測序儀,同時還建立了全系列多型號的自動化裝置和試劑耗材等產品矩陣,致力於滿足使用者在組學領域不同應用場景的使用需求,為精準醫療、精準農業和精準健康等行業提供實時、全景、全生命週期的生命數字化裝置和系統。