在6世紀初日本朝廷的政治組織整備過程中,蘇我氏急速發展,一度成為了僅次於皇室的日本第二大勢力。但是在大化改新後,蘇我氏的勢力卻衰退了。
蘇我氏的發展起步於蘇我稻目出任大臣。他在欽明天皇的領導下,負責處理朝政,並把自己的兩個女兒都嫁給了欽明天皇為後。後來蘇我稻目的兒子蘇我馬子當家時,蘇我氏的勢力開始急劇膨脹。
在欽明天皇之後即位的是敏達天皇。當時蘇我氏與大連物部氏持續敵對,但由於敏達天皇的皇后炊屋姬是蘇我稻目的女兒堅鹽姬的女兒,蘇我馬子(炊屋姬的舅舅)的地位獲得了逐步提升。
敏達天皇駕崩後,皇后炊屋姬主張讓自己的兄長用明天皇即位,蘇我氏成為了天皇的母族,地位更加鞏固。
用明朝的日本政治以炊屋姬的舅舅蘇我馬子為中心,物部守屋的地位逐漸下降了。及至用明天皇駕崩,物部守屋想擁立與自己親近的穴穗部皇子,可惜蘇我馬子搶先一步暗殺了皇子。緊接著蘇我馬子組織起豪族聯合軍討伐了物部守屋。其實,即便此時物部氏不被討伐,也已無法擺脫在朝廷中逐漸沒落的命運了。
這一時期的蘇我氏重視渡來系氏族(就是從朝鮮半島或中國大陸移居日本列島的歸化人),利用他們先進的統治技巧強化中央集權。東漢氏是當時控制著眾多渡來系中小氏族的一大豪門,也是蘇我氏拉攏到己方陣營的重要盟友。在蘇我氏的領導下,白豬氏負責經營屯倉(皇室領);船氏負責管理難波的港灣稅。
討伐了物部氏以後,蘇我馬子擁立了自己妹妹小姉君的兒子——崇峻天皇。然而,蘇我馬子與崇峻天皇的關係卻並不好,他與堅鹽姬系的皇族親近,疏遠小姉君系的人。究其原因,可能是因為在一夫多妻制的情況下,蘇我馬子與堅鹽姬的母親是同一個人或關係很近的兩個人;而蘇我馬子的母親與小姉君的母親關係較遠吧。
即位不久,崇峻天皇就策劃除掉蘇我馬子,卻被馬子搶先一步派東漢駒(人名)暗殺了天皇。後來,推古天皇(炊屋姬)即位,蘇我馬子和聖德太子共同執政。制定冠位十二階、派遣遣隋使、大興佛教……在這一時期很多中國化的政策被大力推進。
蘇我馬子還加強了自家與巨勢、紀、葛城等武內宿禰系豪族的聯繫,架空了天皇,自己以“第一大臣”的身份主持朝政。如果蘇我氏後來沒有失勢的話,其子孫很可能會壟斷類似攝政、關白這樣的職位,成為日本第一貴族。
蘇我馬子死後,其子蘇我蝦夷繼任了大臣。然而他缺乏父親那樣的高水平政治手腕,到了7世紀中葉蘇我氏的地位顯著下降了。
蘇我蝦夷的兒子蘇我入鹿力圖重振家族。他任用東漢氏構建自己的軍事力量,並建造巨型墳墓和恢弘宅邸,提升蘇我氏的權威。入鹿還和擁有蘇我氏血統的古人大兄皇子結盟,出臺各種中央集權化政策。可是這些舉動卻招致了皇室的嫡系——中大兄皇子的反感。中大兄皇子意欲暗殺蘇我入鹿,在三韓的貢物被晉獻給天皇的那天成功幹掉了他。隨後,在法興寺集結眾豪族的兵力討伐蘇我蝦夷,使其被迫自殺。
蘇我入鹿的從弟蘇我石川麻呂由於追隨中大兄皇子,在大化改新後被任命為了右大臣。可惜的是蘇我石川麻呂和他的弟弟們在7世紀後半葉的一次又一次政治鬥爭中沒落了,只有蘇我連子這一個弟弟的家族撐到了奈良時代。可以說,大化改新後,蘇我氏家族便全面衰退了。