本次分享一篇利用GEO、TCGA資料探勘發了4.7 分SCI論文,論文發表在lung cancer 上,該期刊影響因子:4.7,屬於非OA期刊,難度可以堪比5-8分的OA期刊,這種專業的非OA期刊都是有固定發文量的,純生信資料探勘可以發在這樣的期刊說明是非常棒的。
文章題目:Identification of a novel gene expression signature associated with overall survival in patients with lung adenocarcinoma: A comprehensive analysis based on TCGA and GEO databases(DOI: 10.1016/j.lungcan.2020.09.014)
文章的分析內容都是常規TCGA資料差異分析篩選差異基因、GO、KEGG富集分析、單因素Cox迴歸分析、多因素Cox迴歸分析、計算風險評分、生存分析,所有的圖形都很一般,沒有特別漂亮的。
像這種常規沒有結合任何研究熱點的GEO+TCGA資料探勘,1-3分OA期刊的SCI滿天飛,而偏偏這篇純生信資料探勘可以發在4.7分的非OA期刊。為什麼要強調非OA?因為OA期刊發文量大,容易被認為在“灌水”。有三十幾個OA期刊被個別有名氣的單位列入經費不予支援與鼓勵的名單,其中就包含一個8分多的OA期刊。同時一些基金評審專家可能對一些聲譽不好的OA期刊反感,特別是在名單內的期刊。
這篇文章之所以能發表在一個4.7分的非OA期刊,主要是因為下面這些亮點之處:
1、常規差異分析都是tumor比上normal,但是作者進行創新:early stage 比上normal,advanced stage 比上early stage
2、多因素Cox迴歸的結果非常好
3、有多套GEO資料進行獨立驗證模型,並且驗證結果都非常好
4、遇上對的審稿人(也不能百分百排除運氣成分)